Question

自最新的R更新以来，我得到了注释

summary.xmlImport：“中位数”没有可见的全局函数定义

CRAN检查中的

。附加说明参考了read.table，write.table和其他标准函数。

当我查看我的文件summary.xmlImport时，文件如下所示：

summary.xmlImport <- function(object, ...){

   rowCount <- sapply(object,nrow)
   cat("Summary of xmlImport object\n")
   cat("---------------------------\n")
   cat("Sequences    :",length(object),"\n")
   cat("Min hits     :",min(rowCount),"\n")
   cat("Average hits :",mean(rowCount),"\n")
   cat("Median hits  :",median(rowCount),"\n")
   cat("Max hits     :",max(rowCount),"\n")
   invisible(object)

}

我无法理解，为什么我现在应该将median功能添加到NAMESPACE，但为什么不添加min，mean等。这个注释只是关于{{1 }}功能。

任何人都知道Note的原因是什么以及如何修复它？我注意到有大量的R包当前具有相同的注释。

我可以在非声明变量的上下文中理解这个警告，但我认为median，median()这些函数在R中是全局可见的，尤其是read.table()似乎是！？

编辑：我只收到关于CRAN的注释，但是没有在我的本地计算机上收到什么使搜索解决方案有点讨厌...我的计算机的会话信息：

mean()

Answer 1

从Monday June 29, 2015开始，必须在NAMESPACE中显式导出所有非基础函数才能传递R CMD check --as-cran。之所以进行更改，是因为现在仅使用 base 附件检查代码，因此必须明确列出默认包中的函数（例如 stats ）。

要导入这些包，请考虑执行以下操作：

在DESCRIPTION中，您可能希望在Imports中列出它们。没有理由在Depends列出包裹。
在NAMESPACE中，您可以选择import(stats)或importFrom(stats, ...)，其中...是一个或多个以逗号分隔的函数名称。（如果您使用roxygen2::roxygenize()或devtools::document()生成文档和NAMESPACE，则类似的标记将为#' @import stats和#' @importFrom stats ...。）

如果您希望以模仿此的模式与R交互式工作，您将需要仅使用附加的基础软件包启动R. There are several ways to do this，但最简单的方法是在shell上设置一个环境变量：R_DEFAULT_PACKAGES=NULL或.Renviron文件，然后使用R --vanilla启动R.在终端或bash中，这将是：

$ export R_DEFAULT_PACKAGES=NULL
$ R --quiet --vanilla
> search()
[1] ".GlobalEnv"   "Autoloads"    "package:base"

在Windows命令提示符下，它将是：

C:\>SET R_DEFAULT_PACKAGES=NULL
C:\>R --quiet --vanilla
> search()
[1] ".GlobalEnv"   "Autoloads"    "package:base"

“中位数”

1 个答案: