我在data.frame中有几千个主题的细胞计数数据,具有以下布局:
我想生成ggplot2抖动图,沿Y轴的百分比,沿X轴的单元类型类别(总共5个),并根据其组(实验或控制)进一步着色数据点。如果我可以使用Group颜色的阴影中的不同实验对数据点进行进一步着色(即实验编号从浅到深定义渐变 - 那么将是很好的 - 所有实验-1点都是亮的 - 红色或蓝色基于他们属于哪个集团),但我不知道这是否可能。
对于初学者:我的数据是否已经正确布局以尝试创建此情节?我问的原因是我重新调试yfeel就像我在试图用当前布局中的data.frame绘制任何东西来对抗ggplot2(但是原生的boxplot()似乎可以很好地修改......)
非常感谢任何正确方向的帮助或推动。
编辑:
这是dput(head(dat, 10))
的输出。
structure(list(Neutrophils = c(38, 70.7, 62.1, 90.5, 65.8, 39.2,
89.4, 91.3, 55.4, 14.5), Lymphocytes = c(47.5, 17.1, 20.3, 2,
25, 37.1, 6.3, 1.6, 31.3, 61.5), Monocytes = c(12.4, 11.8, 14.6,
4.8, 7.3, 14.1, 3.7, 4.6, 8.4, 21.9), Eosinophils = c(1.4, 0.1,
2.5, 2.4, 1.4, 9.2, 0.1, 2.5, 4.6, 1.3), Basophils = c(0.8, 0.3,
0.5, 0.3, 0.5, 0.4, 0.5, 0, 0.3, 0.8), Group = c(1L, 1L, 1L,
1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L)), .Names = c("Neutrophils", "Lymphocytes",
"Monocytes", "Eosinophils", "Basophils", "Group"), row.names = c("B145",
"B196", "B212", "B246", "B250", "B286", "B343", "B355", "B369",
"B386"), class = "data.frame")
答案 0 :(得分:1)
首先,您需要使用melt
包中的reshape
功能重塑数据。
我确信有人会更优雅地在渐变上着色点,但您可以通过创建一个颜色与组和/或实验匹配的新列来手动完成。 然后将该颜色美学映射到该列。
答案 1 :(得分:0)
如果我可以继续下去会很棒 为不同的数据点着色 本集团的阴影实验 颜色(即实验编号 定义从浅到深的渐变 - 所有实验-1点都很轻 - 基于红色或蓝色 他们属于哪个集团),但我 不知道这是否可能。
目前不对,抱歉。