我在社区数据上使用vegan :: rarecurve。
lac.com.data<-wisconsin(lac.com.data)
rarecurve(lac.com.data)
不幸的是，我收到错误，无法弄清楚如何修复它。
seq.default（1，tot [i]，by = step）出错：'by'参数错误登录
我试过
rarecurve(lac.com.data,step=1)
无济于事。
我已经生成了一个tabasco（）图并在数据框上执行了威斯康星标准化而没有任何问题。
答案 0 :(得分：3)
没有可重复的例子。但是，您的使用是错误的。函数rarecurve需要计数的输入数据：它从每个抽样单位（行）中抽取个体，因此您必须拥有关于个体的数据。该错误是由使用wisconsin(lac.com.data)引起的：之后所有rowSums(lac.com.data)都是1，而您的数据是非整数。您不能将rarecurve用于wisconsin()转换后的数据或任何其他非整数数据。这里出现的错误是因为估计的个体数量（变换数据的行数均为1）低于物种数量（> 1）。
显然我们需要检查rarecurve中的输入。我们假设人们会知道需要什么样的输入，但我们错了。