Question

我使用图表工具GraphView()生成过滤图。

g = gt.GraphView(g, vfilt= label_largest_component(g, directed=False))

原始图g有10,069个顶点，而结果图有9,197个。但是，使用新的（已过滤的）图表，当我使用indeg = g.degree_property_map("in")列出度数时，list(indeg.a)中的元素总数仍为10,069。当使用9,197个节点绘制新的过滤图时，这会成为问题，其中顶点大小设置为indeg的函数，主要是因为元素数量不匹配。

代码段看起来像这样

g = load_graph("ppnet.xml")
g = GraphView(g, vfilt=label_largest_component(g, directed=False))
indeg = g.degree_property_map("in")
indeg.a = np.sqrt(indeg.a) + 2
graph_draw(g, vertex_size = indeg, vertex_fill_color=indeg, pos = sfdp_layout(g),
    vcmap=plt.cm.gist_heat, output_size=(400, 400), output="gc.png")

运行时，会提供以下ValueError

ValueError: operands could not be broadcast together with shapes (10069,) (9197,)

为GraphView对象添加预期样式的正确方法是什么？

Answer 1

找到解决方案。我首先创建了GraphView对象的副本，然后清除了此副本的顶点。请注意，为了清晰起见，我引入了一个新变量g，而不是保留变量名gc。

g = load_graph("ppnet.xml")
gc = GraphView(g, vfilt=label_largest_component(g, directed=False)).copy()
gc.purge_vertices()
indeg = gc.degree_property_map("in")
indeg.a = np.sqrt(indeg.a)+2
graph_draw(gc, vertex_size = indeg, vertex_fill_color=indeg, pos = sfdp_layout(gc),
    vcmap=plt.cm.gist_heat, output_size=(400, 400), output="gc.png")

图形工具GraphView对象

1 个答案: