无法在R中训练KSVM

时间:2015-06-13 13:26:32

标签: r svm

我整天都在这。假设我有一个类似下面的培训数据

1.0000000 0.8260869 0
0.7333333 0.4666667 0
0.0000000 0.0000000 0
0.3076923 0.3076923 0
0.2307692 0.4615385 0
0.9333333 0.4666667 1
0.3157895 0.4210526 1
1.0000000 0.7000000 1
0.3157895 0.2631579 1
0.6666667 0.4444444 1

前几列是我们的功能集,每行的最后一列是我们试图学习/预测的标签。

但是当我尝试使用以下脚本为上述数据训练SVM时,我写道:

library(kernlab)
library(Matrix)

kp = function(d, e){
    gama = 0.25

    DA = d[,1]
    DB = d[,2]
    DE = e[,1]
    DF = e[,2]


    q1 = (norm(as.matrix(DA-DE)))^2
    q2 = (norm(as.matrix(DB-DF)))^2
    q3 = (norm(as.matrix(DA-DF)))^2
    q4 = (norm(as.matrix(DB-DE)))^2

    s1 = min((q1+q2),(q3+q4))

    s = (norm(as.matrix(s1)))^2

    exp(-gama*s)
}

data    <- read.csv(file = "dataset.dat", stringsAsFactors = TRUE, nrows = 10)

xtrain  <- as.matrix(data[,1:2])

ytrain  <- as.matrix(data[,687])

class(kp)<-"kernel"

ksvm(x = xtrain, y = ytrain, type = "C-svc", kernel = kp, C = 128, scale = FALSE)

我收到以下错误

Error in indexes[[j]] : subscript out of bounds
Calls: ksvm -> ksvm -> .local
Execution halted

我用Google搜索了,但我无法提出解决方案。

问题:

我做错了什么,我怎样才能让它发挥作用!?

修改

traceback()的结果如下:

3: .local(x, ...)
2: ksvm(x = xtrain, y = ytrain, type = "C-svc", kernel = kp, C = 128)
1: ksvm(x = xtrain, y = ytrain, type = "C-svc", kernel = kp, C = 128)

还有dput(data)

structure(list(X0.8 = c(1, 0.7333333, 0, 0.3076923, 0.2307692), X0.7 = c(0.8260869, 0.4666667, 0, 0.3076923, .4615385)), .Names = c("X0.8",  "X0.7"), row.names = c(NA, 5L), class = "data.frame")

2 个答案:

答案 0 :(得分:0)

我遇到了同样的问题,问题实际上是我的数据集中存在一些无限元素。

您可以使用apply(xtrain,2,range)之类的东西来检查它们,然后使用xtrain $ your_var [xtrain $ your_var == Inf]&lt; -0将它们任意设置为零。

答案 1 :(得分:0)

在我的情况下,问题是NA值。 我删除了它们,我想通了