在灰度图像中获得类似彩色轮廓的斑点

Question

我想在这些图像中选择人员行作为单独的blob：

这可能吗？

修改：我想要选择的区域显示在此图片中（粗略地说，我是手动选择的）：

如果其他blob也被选中，那也没关系（之后我可以按照它们的区域过滤它们）。

Answer 1

这是让你入门的东西。我正在制作您展示的第一张图片。我看到你将scikit-image作为标记包含在内，所以我假设你是用Python开发的。因此，我将使用Python包装器来帮助我们执行此操作。请注意，我选择的此算法的每个步骤的参数特别适用于第一个图像。您必须使用这些参数来使其他图像生效。

这是我做的：

1. 读入图片并通过cv2.cvtColor
转换为灰度
2. 通过cv2.adaptiveThreshold执行自适应阈值，以便从背景中最佳地分割出形状。它们看起来像火车，因此我将从这里称这些形状的火车。
3. 执行形态二元关闭以关闭通过cv2.morphologyEx进行阈值处理所产生的任何间隙，并使用椭圆结构元素
4. 填写所有洞。基本上，您可以将孔视为被白色包围的黑色像素区域。执行此操作的常见方法是执行填充操作，种子像素从图像的左上角开始，然后反转结果以获得这些孔。一旦我们有这些洞，我们将使用这个掩码索引步骤＃3中的图像并将这些像素设置为白色。我使用cv2.floodFill。请注意，输入图像是这样的，您可以删除上下行以及最左侧和最右侧的列，并且必须在调用函数之前初始化存储泛洪结果的输出图像。
5. 通过cv2.findContours找到图像中的轮廓。
6. 浏览每个轮廓并过滤掉面积小于一定量的轮廓。我使用cv2.contourArea来帮助我做到这一点。
7. 对于剩余的轮廓，请使用cv2.drawContours
填充白色轮廓

假设第一个图像被称为train1.png，这是代码！

# Import relevant libraries
import numpy as np
import cv2

# Read in image and convert to grayscale
im1 = cv2.imread('train1.png')
im1 = cv2.cvtColor(im1, cv2.COLOR_BGR2GRAY)

# Adaptive Threshold
thresh = cv2.adaptiveThreshold(im1, 255,
                            adaptiveMethod=cv2.ADAPTIVE_THRESH_MEAN_C,
                            thresholdType=cv2.THRESH_BINARY_INV,
                            blockSize=21,
                            C=2)

# Morphology to close gaps
se = cv2.getStructuringElement(cv2.MORPH_RECT, (15,15))
out = cv2.morphologyEx(thresh, cv2.MORPH_CLOSE, se)

# Find holes
mask = np.zeros_like(im1)
cv2.floodFill(out[1:-1,1:-1].copy(), mask, (0,0), 255)
mask = (1 - mask).astype('bool')

# Fill holes
out[mask] = 255

# Find contours
contours,_ = cv2.findContours(out.copy(),
                              cv2.RETR_EXTERNAL,
                              cv2.CHAIN_APPROX_NONE)

# Filter out contours with less than certain area
area = 50000
filtered_contours = filter(lambda x: cv2.contourArea(x) > area,
                           contours)

# Draw final contours
final = np.zeros_like(im1)
cv2.drawContours(final, filtered_contours, -1, 255, -1)

cv2.imshow('Shapes', final)
cv2.waitKey(0)
cv2.destroyAllWindows()
cv2.imwrite('train1_final.png', final)

这是我得到的图像。它并不完美，但它足以让你开始。