Question

我有一些来自毒性试验的数据。我的反应变量是Plutei，这是收集的正常形状幼虫（6个重复）的数量：

来自2个不同的物种
一年中的5个不同时间
在3个不同的网站上。

我用以下方法治疗了这只幼虫：

3种不同的金属
每种浓度为6种（分析毒性）。

我想评估每个因素（及其相互作用）在我测量的Plutei响应中的重要性，我想用adonis中的vegan函数来做包，版本2.2-1。

我已经创建了这样一个数据框：

Time  Species        Site       Metal  Concentration  Plutei  Replicates
T1    Paracentrotus  Antignano  Zn                60      78           1
T1    Paracentrotus  Antignano  Zn                60      78           2
T1    Paracentrotus  Antignano  Zn                60      77           3
T1    Paracentrotus  Antignano  Zn                60      80           4
T1    Paracentrotus  Antignano  Zn                60      80           5
T1    Paracentrotus  Antignano  Zn                60      79           6
T1    Paracentrotus  Antignano  Zn                70      70           1
T1    Paracentrotus  Antignano  Zn                70      69           2
T1    Paracentrotus  Antignano  Zn                70      70           3
T1    Paracentrotus  Antignano  Zn                70      71           4

这是str(mydata)：

str(mydata) 'data.frame': 3241 obs. of 7 variables:
 $ Time : Factor w/ 6 levels "T1","T2","T3",..: 6 1 1
 $ Species : Factor w/ 3 levels "Arbacia","Paracentrotus",..: 3 2
 $ Site : Factor w/ 4 levels "Antignano","Chioma",..: 4 1
 $ Metal : Factor w/ 4 levels "Cd","Cu","Metal",..: 3 4
 $ Concentration: Factor w/ 23 levels "100","100/70",..: 23 15 1
 $ Plutei : Factor w/ 90 levels "0","1","10","11",..: 90 77 77 76
 $ Repl : Factor w/ 7 levels "1","2","3","4",..: 7 1 2 3 4 5 6 1 2 3 ...

当我尝试运行adonis函数时，

perm <- adonis(Plutei ~ Time * Species * Site * Metal, data = mydata, permutations = 999)

我收到此消息：

Error in rowSums(x, na.rm = TRUE) : 
  'x' must be an array of at least two dimensions

我做错了什么？

使用adonis函数时出错

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