加载dplyr包时改变stats :: lag的行为

时间:2015-05-26 19:00:51

标签: r dplyr

使用时我遇到stats::lag功能问题 dplyr包。具体来说,我从滞后得到不同的结果 加载dplyr之前和之后的函数。

例如,这是一个示例时间序列。如果我计算滞后 k = -1,滞后系列始于1971年。

data <- ts(1:10, start = 1970, frequency = 1)
lag1 <- stats::lag(data, k = -1)
start(lag1)[1]

## [1] 1971

现在,如果我加载dplyr,则同一个调用会产生一个从中开始的滞后序列 1970。

library(dplyr)

## 
## Attaching package: 'dplyr'
## 
## The following object is masked from 'package:stats':
## 
##     filter
## 
## The following objects are masked from 'package:base':
## 
##     intersect, setdiff, setequal, union

lag2 <- stats::lag(data, k = -1)
start(lag2)[1]

## [1] 1970

start(lag1)[1] == start(lag2)[1]

## [1] FALSE

考虑到加载dplyr时的警告,我的猜测是必须这样做 与环境。但是,分离dplyr似乎没有帮助。

detach("package:dplyr", unload = TRUE, character.only = TRUE)
lag3 <- stats::lag(data, k = -1)
start(lag3)[1]

## [1] 1970

start(lag1)[1] == start(lag3)[1]

## [1] FALSE

非常感谢任何建议。到目前为止,我唯一的解决办法是 在计算lag1lag2之间重新启动R会话。

这是我的会议:

##  setting  value                       
##  version  R version 3.2.0 (2015-04-16)
##  system   i386, mingw32               
##  ui       RTerm                       
##  language (EN)                        
##  collate  English_Canada.1252         
##  tz       America/New_York            
## 
##  package    * version  date       source        
##  assertthat   0.1      2013-12-06 CRAN (R 3.2.0)
##  bitops       1.0-6    2013-08-17 CRAN (R 3.2.0)
##  DBI          0.3.1    2014-09-24 CRAN (R 3.2.0)
##  devtools     1.8.0    2015-05-09 CRAN (R 3.2.0)
##  digest       0.6.8    2014-12-31 CRAN (R 3.2.0)
##  dplyr        0.4.1    2015-01-14 CRAN (R 3.2.0)
##  evaluate     0.7      2015-04-21 CRAN (R 3.2.0)
##  formatR      1.2      2015-04-21 CRAN (R 3.2.0)
##  git2r        0.10.1   2015-05-07 CRAN (R 3.2.0)
##  htmltools    0.2.6    2014-09-08 CRAN (R 3.2.0)
##  httr       * 0.6.1    2015-01-01 CRAN (R 3.2.0)
##  knitr        1.10.5   2015-05-06 CRAN (R 3.2.0)
##  magrittr     1.5      2014-11-22 CRAN (R 3.2.0)
##  memoise      0.2.1    2014-04-22 CRAN (R 3.2.0)
##  Rcpp         0.11.6   2015-05-01 CRAN (R 3.2.0)
##  RCurl        1.95-4.6 2015-04-24 CRAN (R 3.2.0)
##  rmarkdown    0.6.1    2015-05-07 CRAN (R 3.2.0)
##  rversions    1.0.0    2015-04-22 CRAN (R 3.2.0)
##  stringi      0.4-1    2014-12-14 CRAN (R 3.2.0)
##  stringr      1.0.0    2015-04-30 CRAN (R 3.2.0)
##  XML          3.98-1.1 2013-06-20 CRAN (R 3.2.0)
##  yaml         2.1.13   2014-06-12 CRAN (R 3.2.0)

我也按照@BondedDust:

的建议尝试了unloadNamespace
unloadNamespace("dplyr")  
lag4 <- stats::lag(data, k = -1)  

## Warning: namespace 'dplyr' is not available and has been replaced  
## by .GlobalEnv when processing object 'sep'  

start(lag4)[1]  

## [1] 1970  

start(lag1)[1] == start(lag4)[1]  

## [1] FALSE

1 个答案:

答案 0 :(得分:18)

dplyr包有效地覆盖&#39;滞后&#39;调度机制没有找到lag,因为该名称实际上没有任何功能,只有两份lag.default,一份属于&#39;属性&#39;还有一个在&#39; dplyr&#39;而且&#39; dplyr&#39;首先找到副本。您可以使用::: - 机制强制查找统计信息版本:

> lag2 <- stats::lag.default(data, k = -1)
Error: 'lag.default' is not an exported object from 'namespace:stats'

> lag2 <- stats:::lag.default(data, k = -1)
> stats::start(lag2)[1]
[1] 1971

dplyr:::lag.default不使用时间序列特定功能。我无法解释为什么unloadNamespace无法删除函数的定义,但它仍然存在:

> unloadNamespace("dplyr")
> getAnywhere(lag.default)
2 differing objects matching ‘lag.default’ were found
in the following places
  registered S3 method for lag from namespace dplyr
  namespace:stats
Use [] to view one of them

进一步的怪异:卸载dply - 命名空间后,我看到了:

> environment(getAnywhere(lag.default)[1])
<environment: namespace:dplyr>
> environment(getAnywhere(lag.default)[2])
<environment: namespace:dplyr>
> environment(getAnywhere(lag.default)[3])
<environment: namespace:stats>

(然后重新启动并加载dplyr,我看到同样明显的双重输入。)

dplyr::lag的帮助页面也有些奇怪:

> help(lag,pac=dplyr)
No documentation for ‘lag’ in specified packages and libraries:
you could try ‘??lag’
> help(`lag`,pac=`dplyr`)
No documentation for ‘lag’ in specified packages and libraries:
you could try ‘??lag’
> help(`lag.default`,pac=`dplyr`)  # This finally succeeds!

查看github(在确定我在CRAN上有最新版本的dplyr之后),我发现这是R CMD check进程的问题:https://github.com/hadley/dplyr/commit/f8a46e030b7b899900f2091f41071619d0a46288。显然lag.default在将来的版本中不会被覆盖,但lag将掩盖统计数据版本。我想知道lag.zoolag.zooreg会发生什么。也许它会在包装加载时宣布覆盖或掩盖?