numpy切片数组而不复制它

时间:2015-05-14 13:01:43

标签: python arrays numpy pandas

我在矩阵x中有大量数据,我需要分析一些子矩阵。

我使用以下代码选择子矩阵:

>>> import numpy as np
>>> x = np.random.normal(0,1,(20,2))
>>> x
array([[-1.03266826,  0.04646684],
       [ 0.05898304,  0.31834926],
       [-0.1916809 , -0.97929025],
       [-0.48837085, -0.62295003],
       [-0.50731017,  0.50305894],
       [ 0.06457385, -0.10670002],
       [-0.72573604,  1.10026385],
       [-0.90893845,  0.99827162],
       [ 0.20714399, -0.56965615],
       [ 0.8041371 ,  0.21910274],
       [-0.65882317,  0.2657183 ],
       [-1.1214074 , -0.39886425],
       [ 0.0784783 , -0.21630006],
       [-0.91802557, -0.20178683],
       [ 0.88268539, -0.66470235],
       [-0.03652459,  1.49798484],
       [ 1.76329838, -0.26554555],
       [-0.97546845, -2.41823586],
       [ 0.32335103, -1.35091711],
       [-0.12981597,  0.27591674]])
>>> index = x[:,1] > 0
>>> index
array([ True,  True, False, False,  True, False,  True,  True, False,
        True,  True, False, False, False, False,  True, False, False,
       False,  True], dtype=bool)
>>> x1 = x[index, :] #x1 is a copy of the submatrix
>>> x1
array([[-1.03266826,  0.04646684],
       [ 0.05898304,  0.31834926],
       [-0.50731017,  0.50305894],
       [-0.72573604,  1.10026385],
       [-0.90893845,  0.99827162],
       [ 0.8041371 ,  0.21910274],
       [-0.65882317,  0.2657183 ],
       [-0.03652459,  1.49798484],
       [-0.12981597,  0.27591674]])
>>> x1[0,0] = 1000
>>> x1
array([[  1.00000000e+03,   4.64668400e-02],
       [  5.89830401e-02,   3.18349259e-01],
       [ -5.07310170e-01,   5.03058935e-01],
       [ -7.25736045e-01,   1.10026385e+00],
       [ -9.08938455e-01,   9.98271624e-01],
       [  8.04137104e-01,   2.19102741e-01],
       [ -6.58823174e-01,   2.65718300e-01],
       [ -3.65245877e-02,   1.49798484e+00],
       [ -1.29815968e-01,   2.75916735e-01]])
>>> x
array([[-1.03266826,  0.04646684],
       [ 0.05898304,  0.31834926],
       [-0.1916809 , -0.97929025],
       [-0.48837085, -0.62295003],
       [-0.50731017,  0.50305894],
       [ 0.06457385, -0.10670002],
       [-0.72573604,  1.10026385],
       [-0.90893845,  0.99827162],
       [ 0.20714399, -0.56965615],
       [ 0.8041371 ,  0.21910274],
       [-0.65882317,  0.2657183 ],
       [-1.1214074 , -0.39886425],
       [ 0.0784783 , -0.21630006],
       [-0.91802557, -0.20178683],
       [ 0.88268539, -0.66470235],
       [-0.03652459,  1.49798484],
       [ 1.76329838, -0.26554555],
       [-0.97546845, -2.41823586],
       [ 0.32335103, -1.35091711],
       [-0.12981597,  0.27591674]])
>>> 

但我希望x1只是一个指针或类似的东西。每次我需要子矩阵时复制数据对我来说太贵了。 我怎么能这样做?

编辑: 显然numpy数组没有任何解决方案。从这个角度来看,熊猫数据框架是否更好?

3 个答案:

答案 0 :(得分:1)

数组x的信息汇总在.__array_interface__属性

In [433]: x.__array_interface__
Out[433]: 
{'descr': [('', '<f8')],
 'strides': None,
 'data': (171396104, False),
 'typestr': '<f8',
 'version': 3,
 'shape': (20, 2)}

它有数组shapestrides(此处为默认值)和指向数据缓冲区的指针。 view可以指向同一个数据缓冲区(可能更进一步),并拥有自己的shapestrides

但是使用布尔值进行索引不能用这几个数字汇总。它必须一直携带index数组,或者从x数据缓冲区复制所选项。 numpy选择复制。您可以选择何时应用index,现在或更远的调用堆栈。

答案 1 :(得分:0)

如果您可以使用传统切片进行管理,例如

x1 = x[3:8]

然后它只是一个指针。

你看过使用蒙面数组了吗?你或许可以完全按照自己的意愿行事。

x = np.array([0.12, 0.23],
             [1.23, 3.32],
               ...
             [0.75, 1.23]])

data = np.array([[False, False],
                 [True, True],
                ...
                 [True, True]])

x1 = np.ma.array(x, mask=data)
## x1 can be worked on and only includes elements of x where data==False

答案 2 :(得分:0)

由于indexbool类型的数组,因此您正在进行高级索引。并且docs 说:“高级索引总是返回数据的副本。”

这很有道理。与只需要知道开始,停止和步骤的普通索引相比,高级索引可以使用原始数组中的任何值,而无需这么简单的规则。这意味着有很多额外的元信息,其中引用的索引指向可能使用比副本更多的内存。