Question

我的代码出现以下错误：数据类型“country”未被理解。我是python的新手，我基本上都在努力学习如何使用.csv文件。我正在使用python 3.4和编辑器Canopy。我试图将csv的数据类型格式化为字符串和浮点数，但是一旦我尝试将字符串类型分配给第一个数据列（col由单词 - country指向），我就会收到错误。我试图将国家分配到“a200”类型，相信可以是一个字符串。我在这做错了什么？请清楚，因为我是新人。

代码是这样的：

import csv
import numpy 

def open_with_csv(filename):

    data = []

    with open(filename) as csvin:
        file_reader = csv.reader(csvin, delimiter = ',')
        for line in file_reader:
            data.append(line)

    return data

data_from_csv = open_with_csv('C:\Users\user\Desktop\MDR-TB_burden_estimates_2015-05-07.csv')

print (data_from_csv)

FIELDNAMES = ['country', 'iso2', 'iso3', 'iso_numeric', 'year', 'source_mdr_new', 'source_drs_coverage_new', 'source_drs_year_new', 'e_new_mdr_pcnt', 'e_new_mdr_pcnt_lo', 'e_new_mdr_pcnt_hi', 'e_new_mdr_num', 'e_new_mdr_num_lo', 'e_new_mdr_num_hi', 'source_mdr_ret', 'source_drs_coverage_ret', 'source_drs_year_ret', 'e_ret_mdr_pcnt', 'e_ret_mdr_pcnt_lo', 'e_ret_mdr_pcnt_hi', 'e_ret_mdr_num', 'e_ret_mdr_num_lo', 'e_ret_mdr_num_hi', 'e_mdr_num', 'e_mdr_num_lo', 'e_mdr_num_hi']


print (FIELDNAMES)

DATATYPES = [('country','a200'), ('iso2'), ('iso3'), ('iso_numeric'), ('year'), ('source_mdr_new'), ('source_drs_coverage_new'), ('source_drs_year_new'), ('e_new_mdr_pcnt'), ('e_new_mdr_pcnt_lo'), ('e_new_mdr_pcnt_hi'), ('e_new_mdr_num'), ('e_new_mdr_num_lo'), ('e_new_mdr_num_hi'), ('source_mdr_ret'), ('source_drs_coverage_ret'), ('source_drs_year_ret'), ('e_ret_mdr_pcnt'), ('e_ret_mdr_pcnt_lo'), ('e_ret_mdr_pcnt_hi'), ('e_ret_mdr_num'), ('e_ret_mdr_num_lo'), ('e_ret_mdr_num_hi'), ('e_mdr_num'), ('e_mdr_num_lo'), ('e_mdr_num_hi')]

def load_data(filename, d=','):
    my_csv = numpy.genfromtxt(filename, delimiter=d, skip_header=1, invalid_raise=False, names= FIELDNAMES, dtype = DATATYPES)
    return my_csv

my_csv = load_data('C:\Users\user\Desktop\MDR-TB_burden_estimates_2015-05-07.csv')

Answer 1

看起来你传递给numpy.getfromtxt的参数格式不正确。

如果要将值传递给name和dtype参数，则需要将dtype指定为逗号分隔的字符串：“a200，i4等......”

或者，您可以传递元组（“name”，“type”）对的列表，而不指定names参数。

您可以在此处查看示例： http://docs.scipy.org/doc/numpy/reference/generated/numpy.genfromtxt.html

Answer 2

我相信这会重现你的问题：

In [156]: txt=b"""USA, 123, ux345, 1.24
Canada, 434, xz3444, 3.34
France, 443, 2x453, 4.34
"""    
In [157]: FIELDNAMES=['country','id','code','value']
In [158]: DATATYPES =[('country','a100'),('id'),('code'),('value')]
In [159]: np.genfromtxt(txt.splitlines(), delimiter=',',dtype=DATATYPES, names=FIELDNAMES)

...
--> 847         ndtype = np.dtype(dict(formats=ndtype, names=names))
    848     else:
    849         nbtypes = len(ndtype)

TypeError: data type "country" not understood

这就是你的主题来自哪里。出于某种原因，在解析DATATYPES时，它认为'country'表示一个dtype（与'S100'，'int'相同）。但你的意思是它是一个字段名称。

让我们更正DATATYPES，并为每个字段提供一种类型，而不仅仅是第一种：

In [165]: DATATYPES =[('country','a100'),('id',int),('code','a5'),('value',float)]

In [166]: np.genfromtxt(txt.splitlines(), delimiter=',',dtype=DATATYPES, names=FIELDNAMES)
Out[166]: 
array([(b'USA', 123, b' ux34', 1.24), (b'Canada', 434, b' xz34', 3.34),
       (b'France', 443, b' 2x45', 4.34)], 
      dtype=[('country', 'S100'), ('id', '<i4'), ('code', 'S5'), ('value', '<f8')])

正如Serguei所写，有几种方法可以指定名称和dtypes。是的，如果不清楚，请重新阅读genfromtxt文档。 SO上还有很多genfromtxt个问题和例子。

数据类型“国家”不明白

2 个答案: