Question

我有一个tsv，file1，其结构如下：

col1  col2  col3
1     4     3
22    0     8
3           5

如果打印出来的话，最后一行看起来像3\t\t5。我想用'NA'替换那个空字符串，这样该行就是3\tNA\t5。使用命令行最简单的方法是什么？

Answer 1

直接的方法是

sed -i 's/^\t/NA\t/;s/\t$/\tNA/;:0 s/\t\t/\tNA\t/;t0' file

sed -i编辑文件;
s/a/b/将a替换为b;
s/^\t/\tNA/使用\t替换行尾的NA\t （第一列变为NA）;
s/\t$/\tNA/最后一列相同;
s/\t\t/\tNA\t/在NA;

\t\t

:0 s///; t0如果有替换请重复s///（如果该行中还有其他缺失值）。

Answer 2

awk专为这种情况而设计（在其他一百万人中;-)）

  awk -F"\t" -v OFS="\t" '{
       for (i=1;i<=NF;i++) {
         if ($i == "") $i="NA"
       }
       print $0
 }' file > file.new && mv file.new file

-F="\t"表示字段分隔符（在FS内部也称为awk）是制表符。我们还将输出字段分隔符(OFS)设置为"\t"。

NF是一行数据中的字段数。对于介于1和$i之间的每个值，$1, $2, $3, ...的评估结果为NF。

我们测试$i th元素是否为if ($i == "")为空，如果是，我们将$i th元素更改为包含字符串“NA”。

对于每行输入，我们打印行的（$0）值。

在awk脚本之外，我们将输出写入临时文件，即file > file.new。 &&测试awk脚本没有错误地进行测试，如果正常，则将file.new移到原始文件上。根据项目所需的安全和安全用例，您可能不希望“销毁”原始文件。

IHTH。

如何用值替换tsv中的空字符串？

2 个答案: