使用numba处理和操作numpy数组

时间:2015-05-05 15:22:00

标签: python numpy jit numba

为什么Numba的jit编译一个简单的Numpy数组操作?

这是一个最小的非工作示例,它再现了Numba的编译失败

import numpy as np
from numba import jit

rows = 10
columns = 999999
A = np.empty((rows, columns))
b = np.linspace(0, 1, num=rows)

@jit(nopython=True)
def replicate(A, b):
    for i in range(A.shape[1]):
        A[:, i] = b
    return A #optional

replicate(a, b)

出现以下错误:

TypingError: Failed at nopython (nopython frontend)
Cannot resolve setitem: array(float64, 1d, C, nonconst)[(slice3_type, int64)] = array(float64, 1d, C, nonconst)
File "<ipython-input-32-db24fbe2922f>", line 12

我做错了吗?

顺便说一句,我需要nopython模式,因为在我的现实生活中,我需要执行数组添加,使用标量乘法和经常填充其他数组的数组。而我的理解是,在对象模式下,我无法进行循环jitting,因此我没有看到任何真正的性能提升。

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

Numba不支持nopython模式下的numpy切片。尝试明确展开循环:

rows = 10
columns = 999999
a = np.empty((rows, columns))
b = np.linspace(0, 1, num=rows)

@jit(nopython=True)
def replicate(A, b):
    for i in xrange(A.shape[0]):
        for j in xrange(A.shape[1]):
            A[i, j] = b[i]
    return A #optional

replicate(a, b)