如何使用ggplot2制作复杂的热图?

时间:2015-04-25 15:38:20

标签: r ggplot2 heatmap

我尝试使用ggplot2绘制复杂的热图以及癌症体细胞突变。

数据为here,以下是代码:

application.StartupPath

我得到的照片是这样的: enter image description here

1)如何自动对齐P1,p3和P4?对于X上的样本,它在p1,p3和p4上的特征会自动对齐吗?   2)控制pancels之间空间的任何好主意?例如,减小p1和p2之间或p1和p4之间的间距   3)如何根据聚类结果在X轴上重新排序样品?如何同时控制p1,p3和p4在X轴上的顺序?

1 个答案:

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本周我与你处于同一个位置,对我在ggplot2中的热图的结果非常不满意。就在昨天,我遇到了一个更新的生物导体包,应该有助于面板放置。我建议查看complexheatmaps包,因为vignette非常好。