我在python中使用igraph库。我想知道是否有一种使用字符串作为顶点索引的方法。我知道'name'属性,我可以写
g = igraph.Graph(directed=True)
g.add_vertex('hello')
g.add_vertex('world')
g.add_edge('hello','world')
一切正常。除非我添加两次相同的顶点,例如:
g = igraph.Graph(directed=True)
g.add_vertex('world')
g.add_vertex('hello')
g.add_vertex('hello')
创建两个不同的顶点,如果我现在添加一个边:
g.add_edge('hello','world')
将边添加到匹配'hello'的第一个顶点作为名称。这也表明这种形式的索引具有O(n)复杂度而不是O(1)(即,扫描整个顶点列表直到找到v['name'] == 'hello'
的顶点v。)
所以我在考虑保持顶点名称和索引之间的映射,例如:
mapping = {}
g = igraph.Graph(directed=True)
g.add_vertex('hello')
mapping['hello'] = len(g.vs)-1
g.add_vertex('world')
mapping['world'] = len(g.vs)-1
g.add_edge(mapping['hello'],mapping['world'])
我认为这应该有用,因为我从不删除顶点所以我猜索引应该保持不变。它还具有用于查找的平均速度O(1),其应该比先前的解决方案更好。 不过我想知道:
g.vs[i].index == i
? (即我总是使用vs数组中顶点的位置来引用add_edge()
等函数中的顶点?)len(g.vs)-1
?编辑:关于边缘的相同问题:我保证我会在g.es[len(g.es)-1]
中找到最后添加的边缘吗?
答案 0 :(得分:6)
这也表明这种形式的索引具有O(n)复杂度而不是O(1)
事实并非如此; igraph维护从name
顶点属性的名称到顶点ID(就像你提出的那个)的内部映射,每当你添加或删除顶点时,它都会自动更新。如果有多个具有相同名称的顶点,则映射会选择一个任意顶点,然后返回该一个顶点(一致地)以进行名称查找。在幕后,这一切都是用标准的Python字典完成的。因此,您可以安全地执行以下所有操作:
g.vs.find("foo")
查找name
等于"foo"
的任意顶点。请注意,我们无法阻止用户创建多个具有相同名称的顶点,因为它在igraph可以读取的许多图形格式中有效(例如,GraphML),我们不希望阻止用户阅读它们。 / p>
我总是保证g.vs [i] .index == i?
是的,这保证是真的。但是,以下情况不是:
>>> v = g.vs[12]
>>> g.delete_vertices(...)
>>> g.vs[v.index] == v
原因是顶点和边缘对象非常“笨”,因为它们只存储对它们来源的图形的引用以及它们在图形中的索引 - 但是当图形本身更新时它们不会更新。经验法则是,一旦你改变底层图形,你持有引用的任何顶点或边缘对象都会变为“无效”。
我总是保证当我向图表中添加一个新的顶点时,它的索引将是len(g.vs)-1?
严格地说,这不是由API(作为正式的“合同”)保证的,但是从igraph的开发到目前为止一直是这种情况,我认为没有理由在未来的任何时候改变它。我也经常在我自己的代码中依赖它。这同样适用于边缘。