如何在knitr的pdf输出中用数字标题保持数字位置?

时间:2015-04-17 10:03:28

标签: r knitr r-markdown

我正在使用knitr(1.9.5和1.9.17)和rmarkdown(0.5.3.1),并希望在pdf输出中保持数字位置。生成的pdf文件在使用块选项fig.pos="H"时正常工作。

但是,当设置fig_caption: yes时,数字位置不成立 yaml header。

我该如何解决这个问题?感谢您的任何建议。

编辑:

了解乳胶的漂浮环境。我将float包添加到标题中。

\usepackage{float}

但是生成的tex文件始终在htbp环境中使用figure,而不考虑使用的任何fig.pos选项。手动将htbp更改为H后,所有数字的位置都会保留。

这是我的rmd文件示例:

---
title: "Untitled"
output:
  pdf_document:
    fig_caption: yes
    includes:
        in_header: mystyles.sty
---

# Section 1


Note that the `echo = FALSE` parameter was added to the code chunk to prevent printing of the R code that generated the plot.

Note that the `echo = FALSE` parameter was added to the code chunk to prevent printing of the R code that generated the plot.

Note that the `echo = FALSE` parameter was added to the code chunk to prevent printing of the R code that generated the plot.

Note that the `echo = FALSE` parameter was added to the code chunk to prevent printing of the R code that generated the plot.


```{r fig1, echo=FALSE, fig.height=8.5, fig.pos="H"}
plot(cars)
```

# Section 2

More test

```{r fig2, echo=FALSE, fig.height=8.5, fig.pos="H"}
plot(cars)
```

# Section 3

```{r fig3, echo=FALSE, fig.height=8.5, fig.pos="H"}
plot(cars)
```

More test

8 个答案:

答案 0 :(得分:15)

正如安德鲁指出的那样,这个fig.pos并没有在块中工作,但如果将它放在全局选项中它会起作用:

```{r global_options, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(fig.pos = 'H')
```

编辑:以上显然习惯于在序言中工作并需要\usepackage{float}

header-includes:
 \usepackage{float}

另见here

答案 1 :(得分:13)

更新查看此更好的解决方案here。 (以下问题的摘要仍然很好,但请点击链接以获得更好的解决方案)。

总结一下RStudio中的一些测试

knitr chunk参数fig.pos =" H"只要fig_caption: yes不在yaml标题中,就可以正常工作。

生成的.tex中的每个数字都是这样的

\subsection{my_section}\label{my_section}

\includegraphics{path_to_fig.pdf}

但如果fig_caption: yes在yaml标题中,则.tex看起来像这样

\subsection{my_section}\label{my_section}

\begin{figure}[htbp]
\centering
\includegraphics{path_to_fig.pdf}
\caption{}
\end{figure}

fig.pos = "H"尚未使用,"htbp"代替。

使用RStudio的解决方法:

fig_caption: yes
keep_tex: yes

在yaml以及

header-includes: \usepackage{float}

然后在生成的.tex文件中使用[htbp]搜索并替换[H]

然后在RStudio中打开.tex文件并使用"编译PDF"按钮。

示例.Rmd

---
title: "Testing fig placement with captions"
author: "Andrew Dolman"
date: "1 September 2015"
output: 
  pdf_document: 
    fig_caption: yes
    keep_tex: yes
header-includes: \usepackage{float}
---

This is an R Markdown document. Markdown is a simple formatting syntax for authoring HTML, PDF, and MS Word documents. For more details on using R Markdown see <http://rmarkdown.rstudio.com>.

When you click the **Knit** button a document will be generated that includes both content as well as the output of any embedded R code chunks within the document. You can embed an R code chunk like this:

```{r}
summary(cars)
```

You can also embed plots, for example:

```{r, echo=FALSE, fig.pos="H"}
plot(cars)
```

Note that the `echo = FALSE` parameter was added to the code chunk to prevent printing of the R code that generated the plot.

```{r, echo=FALSE, fig.pos="H"}
plot(cars)
```

答案 2 :(得分:9)

对我来说,添加float软件包,然后在YAML中添加\floatplacement{figure}{H}解决了如下问题:

---
title: "test"
date: "`r Sys.Date()`"
output: 
  pdf_document :
    keep_tex: true
    number_sections: true
header-includes:
 \usepackage{booktabs}
 \usepackage{longtable}
 \usepackage{array}
 \usepackage{multirow}
 \usepackage[table]{xcolor}
 \usepackage{wrapfig}
 \usepackage{float}
 \floatplacement{figure}{H}
---

答案 3 :(得分:6)

虽然@Bangyou提供的答案有效,但它使针织变得复杂。

您还可以为latex中的数字位置设置全局默认选项,包括在YAML标题中包括:

\makeatletter\renewcommand*{\fps@figure}{H}\makeatother

正如here所解释的那样(和\makeat...部分here)。

这样你就可以使用RStudio或rmarkdown :: render中的编织按钮来完成它。

问题是,所有数字都用H强制填充,你不能设置一个浮动数据。

答案 4 :(得分:4)

正如Yihui在他的回答中提到的那样(Figure position in markdown when converting to PDF with knitr and pandoc),我们不能期望太多关于mardown的格式化。要解决此问题,只需编写一些R脚本以将htbp替换为H

与knitr包中的knit相比,我发现rmarkdown中的render更适合导出tex文件。只需记住在您的rmarkdown文件的yaml标头中添加keep_tex: yes

library(rmarkdown)
render('filepath.Rmd')
x <- readLines('filepath.tex')
pos <- grep('begin\\{figure\\}\\[htbp\\]', x)
x[pos] <- gsub('htbp', 'H', x[pos])
writeLines(x, 'filepath.tex')
tools::texi2pdf('filepath.tex', clean = TRUE)  # gives foo.pdf

file.remove('filepath.tex')

答案 5 :(得分:4)

对我有用的选项:

在开头的.tex中:\usepackage{float}

在Rmd的开头:knitr::opts_chunk$set(fig.pos = 'H')。大写的H

在每个带有图像的块中:fig.cap="lorem blabla"out.extra=''(参数值=空字符串)。

需要定义: 在yaml中fig_caption: yeskeep_tex: yes

这些选项使图像保持其位置,可以是include_graphics和R代码生成的图。

我在bookdown环境中使用它们,按预期生成pdf和html:)

答案 6 :(得分:0)

如果其他人遇到此线程,我必须使用小写字母“ h”,并且它在R版本3.5.3和Latex 2018中有效。

```{r, echo=FALSE, fig.pos="h"}
plot(cars)
```

答案 7 :(得分:0)

official documentation中的代码可以帮助我,帮助其他人发现它有用。

---
title: "Example"
author: "Martin"
output: pdf_document
---

```{r}
knitr::knit_hooks$set(plot = function(x, options)  {
  knitr::hook_plot_tex(x, options)
})
```


```{r myplot, echo=FALSE, results='hide', fig.cap='Test', fig.pos='h'}
library(ggplot2)
ggplot(mtcars, aes(mpg, drat)) + geom_point()
```