Question

我有一个带有一个列的文件A，其中包含如下字符串列表：

我想使用文件A中的字符串来grep文件B中包含它们的行，文件B如下所示：

1       0/0     ./.     0/1     0/0
12      0/0     0/0     1/1     ./.
1234    1/1     0/1     ./.     0/0
12345   0/0     0/0     1/1     1/1
123456  1/1     1/1     ./.     ./.

在这种情况下，我正在等待一个完全匹配文件A中的字符串的输出，如下所示：

12      0/0     0/0     1/1     ./.
1234    1/1     0/1     ./.     0/0

我使用过grep -wf A B并且效果很好，但问题是我的真实文件很重，而且过程非常昂贵。有人有任何不同的想法来获得相同的结果，但使用其他命令行？

Answer 1

您可以使用此awk作为替代方法：

awk 'NR==FNR{a[$1]; next} $1 in a' file1 file2
12      0/0     0/0     1/1     ./.
1234    1/1     0/1     ./.     0/0

<强>解释

NR == FNR {                  # While processing the first file
  a[$1]                      # store the 1st field in array a
  next                       # move to next line
}
$1 in a                      # while processing the second file
                             # if 1st field is in array then print it

如何从没有grep -w的文件中提取精确匹配

1 个答案: