我需要你的帮助:)）
我写了一个R脚本，它从给定的tab-seperated txt或xls文件中生成热图。目前，我在xls文件中手动删除了热像中我不想要的所有列。 现在我想自动化它，但我不知道如何:(
有趣的列在所有xls文件中都是相同的，后跟一个单独的名称：
xls-file 1：L1_tpm_xxxx L2_tpm_xxxx L3_tpm_xxxx
xls-file 2：L1_tpm_xxxx L2_tpm_xxxx L3_tpm_xxxx L4_tpm_xxxx L5_tpm_xxxx
如何选择这些列？
感谢您的期待，菲利普
答案 0 :(得分：2)
您可以使用（如果您已在data.frame df中读取数据）：
df <- df[,grep("^L[[:digit:]]+_tpm.*",colnames(df))]
或者您可以显式编写所需的列：
df <- df[,c("L1_tpm_xxxx","L2_tpm_xxxx","L3_tpm_xxxx")]
等...
以下link非常有用; - ）
答案 1 :(得分：0)
如果您认为列位置将在Excel工作表中修复，那么最简单的解决方案就是使用列索引。例如，如果使用read.table将制表符分隔的文本文件作为data.frame导入，然后决定只保留前两列，则可以执行以下操作：
data <- read.table("path_to_file.txt", header=T, sep="\t")
data <- data[,1:2]