我一直在尝试为项目构建图表,并且在填充更多信息之后我一直在尝试识别新添加的边缘。
例如下面你可以看到它的第一次和第二次迭代:
----------------------一般信息图H --------------------- --------
Total number of Nodes in Graph: 2364
Total number of Edges: 3151
----------------------一般信息图G --------------------- --------
Total number of Nodes in Graph: 6035
Total number of Edges: 11245
我遇到的问题是当我尝试使用代码识别新添加的边缘时:
counter = 0
edges_all = list(G.edges_iter(data=True))
edges_before = list(H.edges_iter(data=True))
print "How many edges in old graph: ", len(edges_before)
print "How many edges in new graph: ", len(edges_all)
edge_not_found = []
for edge in edges_all:
if edge in edges_before:
counter += 1
else:
edge_not_found.append(edge)
print "Edges found: ", counter
print "Not found: ", len(edge_not_found)
我得到了这些结果:
How many edges in old graph: 3151
How many edges in new graph: 11245
Edges found: 1601
Not found: 9644
我无法理解为什么我找到了1601而不是11245-3151 = 8094
有什么想法吗?
谢谢!
答案 0 :(得分:1)
首先请注意,Edges found
似乎是H
和G
中的边数。所以它应该只有3151而不是8094.8094应该是Not found
。请注意,找到的边数1601大约是您预期的一半。这是有道理的,因为:
我相信您遇到的问题是,当networkx列出边缘时,边缘可能会在(a,b)
中显示为edges_before
。但是在edges_after
中,它可能会在列表中显示为(b,a)
。
所以(b,a)
不在edges_before
。它将无法通过您的测试。假设边缘订单在列出H
和G
的时间之间没有相关性,您可能会发现其中约有一半通过。您可以执行其他测试,以查看(b,a)
是H
的边缘。这是H.has_edge(b,a)
直接的改进:
for edge in edges_all:
if H.has_edge(edge[0],edge[1]):
counter += 1
else:
edge_not_found.append(edge)
这使您甚至可以避免定义edges_before
。
您还可以避免通过更好的改进来定义edges_all
:
for edge in G.edges_iter(data=True):
if H.has_edge(edge[0],edge[1]):
etc
注意:我已将其写为H.has_edge(edge[0],edge[1])
以明确发生了什么。更复杂的写作方式是H.has_edge(*edge)
。 *edge
符号unpacks the tuple。
最后,使用list comprehension可以更好地获取edge_not_found:
edge_not_found = [edge for edge in G.edges_iter(data=True) if not H.has_edge(*edge)]
这会创建一个由edge
组成的列表,该列表位于G
但不在H
中。
将所有这些放在一起(并使用.size()
命令计算网络边缘数),我们得出一个更清晰的版本:
print "How many edges in old graph: ", H.size()
print "How many edges in new graph: ", G.size()
edge_not_found = [edge for edge in G.edges_iter(data=True) if not H.has_edge(*edge)]
print "Not found: ", len(edge_not_found)
print "Edges found: ", G.size()-len(edge_not_found)