ImageJ中的裁剪自定义形状或等效（TIFF视频文件）

Question

我有一个带有不断增长的光纤的.tiff视频文件，如下图所示

现在  想象一下，这种纤维会不断地在一条直线上生长和收缩。现在，我想以某种方式裁剪出仅包含光纤的视频区域，例如黑色背景图像。

现在，当我播放视频时，我希望看到视频中不断增长的光纤区域以及其他任何地方的黑色背景。

问题：有没有办法预先形成＆＃34; custom＆＃34;在ImageJ中裁剪出不规则形状的物体？

如果您不知道ImageJ是否可以进行此类图像处理，欢迎任何其他软件选项。

感谢您的帮助

Answer 1

是的，您可以在ImageJ中执行此操作。如果您可以找到捕获光纤的阈值方法，则可以将其转换为选择（ROI），然后将Clear Outside转换为其他所有内容：

1. 图片＆gt;调整＆gt;阈值并选择阈值，或使用其中一种自动方法。但是不要申请门槛！
2. 编辑＆gt;选择＆gt;创建选择（将阈值区域转换为ROI）
3. 编辑＆gt;清除外部（使背景变黑 - 假设您已将背景颜色设置为黑色）

如果您想缩小窗口，可以执行Image＆gt;选择激活时裁剪。这会将图像裁剪到ROI的矩形边界框。但是这个尺寸会根据纤维的大小而变化。因此，当光纤处于最大光纤时，您可能希望这样做。