我有一个200x200的模拟模型矩阵,想要计算某些列之间的相关性。这是一些数据:
var1 var2 var3 var4
[1,] 0.000000000 0.0000000000 0.00000000 0.000000000
[2,] 0.081707812 -0.4674752956 -0.09885623 0.311421458
[3,] 0.104660320 -0.5066112338 0.16215542 0.224543735
[4,] 0.148780552 -0.2419104721 -0.01707375 0.122405936
我试图找到var1和var2,var3和var4,var5和var6之间的相关性,依此类推。将相关性输出到100长度矢量将是惊人的。
我将数据拆分为100个200x2矩阵,名为R1,R2等,并使用此代码
for(i in 1:100){
cor[i] <- cor(get(paste0(R,i,))[,1], get(paste0(R,i,))[,2])
}
但是它返回了一个错误
Error in paste0(R, i, ) : object 'R' not found
将数据存储到一个矩阵中显然比一百个更好,但我是R的绝对新手,并且无法在搜索后弄清楚如何执行此操作。
感谢您的帮助。
答案 0 :(得分:2)
以下是您的示例的一种方式:
x <- matrix(c(0.000000000, 0.0000000000, 0.00000000, 0.000000000,
0.081707812, -0.4674752956, -0.09885623, 0.311421458,
0.104660320, -0.5066112338, 0.16215542, 0.224543735,
0.148780552, -0.2419104721, -0.01707375, 0.122405936),
4, 4, byrow = TRUE)
out <- cor(x)
diag(out[c(1,3), c(2,4)])
#[1] -0.5784471 -0.0925900
然后您可以扩展到200x200矩阵:
out <- cor(x)
diag(out[seq(1,200,2), seq(2,200,2)])