使用MyRobustCrust使用Matlab从MNI脑模板创建3D线框皮质模型

Question

我正在尝试使用matlab上的MyRobustCrust从MNI脑模板创建线框3d模型。我的目标是能够确定皮质表面上的MNI坐标。

为此，请按照此网站上列出的说明进行操作：http://soundsfromthenorth.com/?p=3

不幸的是，管理员似乎不再活跃了。

按照网站的说明，我已成功从FSL中提取数据集（＆＃34; MNI152_T1_2mm_brain_mask.nii＆＃34;）。但是，当我去运行MyRobustCrust时，使用以下输入（按照站点的指示），我得到一个空白图。

代码输入

>> [t,tnorm]=MyRobustCrust(p);
figure(1)
hold on
axis equal
h=trisurf(t,p(:,1),p(:,2),p(:,3),'facealpha',0.4,...
...'facecolor',[1 1 1],'edgecolor',[0.8 0.8 0.8]);
view(3);
axis vis3d

代码输出：

Added Shield: 0.0559 s
Delaunay Triangulation Time: 0.6515 s
Connectivity Time: 0.0796 s
Circumcenters Time: 0.0168 s
Warning: Brute continuation necessary 
> In MyRobustCrust>Marking (line 380)
  In MyRobustCrust (line 106) 
Warning: 1000 th level was reached\n 
> In MyRobustCrust>Marking (line 412)
  In MyRobustCrust (line 106) 
99.9941 % of Tetraedroms were checked
Walking Time: 0.2084 s
Manifold extraction Time: 0.3782 s
Total Time: 1.4809 s
 view(3);
        |
Error: Unbalanced or unexpected parenthesis or bracket.

不幸的是，我对神经影像学和Matlab都很陌生。有没有人对我在这里做错了什么有任何建议？错误信号是否表示MyRobustCrust或数据代码中的不平衡或意外括号？

Answer 1

我希望我能正确理解你，但在我看来，你试图将横向平面（轴面）标记带入MNI坐标。

如果是这样，那么也许你应该尝试xjView（注意：需要SPM）。这是一个图形界面，主要用于覆盖模板上的对比，其他功能的音调（创建蒙版，生成统计表等）。在您的情况下，您只需加载默认的MNI图像（来自SPM的avg152T1或T2）并单击右上角的3轴视图; MNI坐标位于左下方。