如何在R中扩展函数以在不同数据集上并行运行?

时间:2015-03-23 03:49:58

标签: r

我创建了一个函数find.string(),它接受​​一个字符串并在其中输出不同的模式。

例如:find.string(" abcabcabc") - " abc"

现在,我想做的是,我有两个包含多行字符向量的大型数据集(如上所述)。现在,我希望在它们两者上并行运行此功能。数据集的格式为:

1 2 "abcabcabc"
2 3 "adcadcadc"
3 4 "yufyufyuf"
4 5 "xyzxyzxyz"
..............

同样地,前两列相同,只有第三列发生变化,我有,

1 2 "fbfbfbfbfb"
2 3 "bbfbfbfbbf"
3 4 "fbffffbfbf"
4 5 "fbfbbbbbbb"
...............

所以,基本上,在合并这两个数据集时,我会有,

1 2 "abcabcabc" "fbfbfbfbfb"
2 3 "adcadcadc" "bbfbfbfbbf"
3 4 "yufyufyuf" "fbffffbfbf"
4 5 "xyzxyzxyz" "fbfbbbbbbb"
...........................

现在,我想在第三个和第二个字符向量上并行运行该函数并存储输出。我怎么能在R?

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

也许data.table方法比尝试并行化代码要快,但我需要您的数据样本以确保此答案解决您的问题

library(data.table)

cols <- c("colstring1", "colstring2")

setDT(data)[, (cols) := lapply (cols, function(x)  find.string(x) )]