Question

String s="CCATGTTGGCCTAGGTGACAC";

我试图从DNA序列上面找到一个开放阅读框。首先，我必须找出是否有＆＃34; ATG＆＃34;作为子字符串出现。如果它在那里，那么我必须找出是否存在这些子字符串中的任何一个＆＃34; TAA＆＃34;，＆＃34; TAG＆＃34;，＆＃34; TGA＆＃34;。在这三个子字符串中，以先到者为准是考虑因素，然后我会打印来自＆＃34; ATG＆＃34;到＆＃34; TAA＆＃34;或者＆＃34; TAG＆＃34;或者＆＃34; TGA＆＃34;以先到者为准。从上面的字符串输出应该是＆＃34; ATG TTGGCC TAG＆＃34;。

Answer 1

您可以获取每个子字符串的索引..

System.out.println(s.indexOf("ax"));

索引最小的那个是第一个。

Answer 2

    String testString = "ddddeeaxgghnnnbykkkkkklllllczfr";


    String[] frags = testString.split("(ax|by|cz)");
    if(frags.length >= 1) {
        System.out.println("first=" + frags[0]);
        if(frags.length >= 2) {
            System.out.println("second=" + frags[1]);
            if(frags.length >= 3) {
                System.out.println("third=" + frags[2]);
            }
        }
    } else {
        System.out.println("nothing found");
    }

打印：

第一= ddddee
  第二= gghnnn
  第三= kkkkkklllll

找到哪个子字符串首先出现，哪个出现在第二个，哪个出现在第三个

2 个答案: