我正在尝试进行连接组件分析。但是我遇到了错误。我需要椎体;但我得到一些其他物体。 图片是:
结果是:
im= imread('im.bmp');
figure,imshow(im);
K1=imadjust(im);
figure, imshow(K1), title('After Adjustment Image')
threshold = graythresh(K1);
originalImage = im2bw(K1, threshold);
originalImage = bwareaopen(originalImage,100);
se = strel('disk', 2); %# structuring element
closeBW = imclose(originalImage,se);
figure,imshow(closeBW);
CC = bwconncomp(closeBW);
L = labelmatrix(CC);
L2 = bwlabel(K1);
figure, imshow(label2rgb(L));
答案 0 :(得分:1)
细分不在我的区域,因此我不确定最佳方法是什么。以下是我提出的几个启发式想法:
看起来您可以从脊椎中获得一定的尺寸。
regionIdxs = unique(L(:));
regionSizes = accumarray(L(:)+1,1);
如果我们查看regionSizes
,我们会看到区域大小(以像素为单位):
213360
919
887
810
601
695
14551
684
1515
414
749
128
173
26658
您想要的区域(第2-6行)的范围是500-1000。我们可以安全地丢弃大小<200或> 2000的区域。
goodRegionIdx = (regionSizes>200) & (regionSizes<2000);
regionIdxs = regionIdxs(goodRegionIdx);
regionSizes = regionSizes(goodRegionIdx);
分布的协方差矩阵的特征值表征其在最宽方向上的大小和与该方向垂直的大小。我们正在寻找脂肪盘形状,因此我们可以期待一个大的特征值和一个中等大小的特征值。
[X,Y] = meshgrid(1:size(L,2),1:size(L,1));
for i = 1:length(regionIdxs)
idx = regionIdxs(i);
region = L==idx;
totalmass = sum(region(:));
Ex(i) = sum( X(1,:).*sum(region,1) ) / totalmass;
Ey(i) = sum( Y(:,1).*sum(region,2)) / totalmass;
Exy(i) = sum(sum( X.*Y.*region )) / totalmass;
Exx(i) = sum(sum( X.*X.*region )) / totalmass;
Eyy(i) = sum(sum( Y.*Y.*region )) / totalmass;
Varx(i) = Exx(i) - Ex(i)^2;
Vary(i) = Eyy(i) - Ey(i)^2;
Varxy(i) = Exy(i) - Ex(i)*Ey(i);
Cov = [Varx(i) Varxy(i); Varxy(i) Vary(i)];
eig(i,:) = eigs(Cov);
end
如果我们查看特征值eig
:
177.6943 30.8029
142.4484 35.9089
164.6374 26.2081
112.6501 22.7570
138.1674 24.1569
89.8082 58.8964
284.2280 96.9304
83.3226 15.9994
113.3122 33.7410
我们只对第1-5行感兴趣,第1-5行的特征值在最大值100-200范围内,第二行50以下。如果我们丢弃这些,请获取以下区域:
goodRegionIdx = (eig(:,1)>100) & (eig(:,1)<200) & (eig(:,2)<50);
regionIdxs = regionIdxs(goodRegionIdx);
我们可以使用逻辑OR |
来绘制区域。
finalImage = false(size(L));
for i = 1:length(regionIdxs)
finalImage = finalImage | (L==regionIdxs(i) );
end
我们似乎得到一个假阳性。查看特征值eig(:,1)./eig(:,2)
的比率是一个想法,但这似乎也有点问题。
您可以尝试某种异常值检测,如RANSAC,以尝试消除您不想要的区域,因为真正的椎骨往往沿着线或曲线在空间上对齐。
我不确定还有什么建议。如果您无法找到另一种区分好与坏的方法,您可能需要研究更高级的分割方法,如机器学习。有一个更严格的预处理方法可能是一件事。
希望有所帮助。