在cython中,如何在不为内容分配内存的情况下创建具有已定义属性的ndarray对象?
我的问题是我想调用一个需要ndarray但我的数据是纯c数组的函数。由于某些限制,我无法直接使用ndarray。
代码分段以说明我的意图:
cdef:
ndarray[npy_uint64] tmp_buffer
uint64_t * my_buffer
tmp_buffer = np.empty(my_buffer_size, dtype='uint64')
my_buffer = <uint64_t *> malloc(my_buffer_size * sizeof(uint64_t))
(... do something with my_buffer that cannot be done with a ndarray ...)
tmp_buffer.data = my_buffer
some_func(tmp_buffer)
这似乎效率低下,因为tmp_buffer
内存被分配并且零填充永远不会被使用。我该如何避免这种情况?
答案 0 :(得分:3)
除了效率之外,这种分配是否会编译?
np.empty
不会填零。 np.zeros
可以做到这一点,甚至可以即时完成这一过程。&#39;
Why the performance difference between numpy.zeros and numpy.zeros_like?探讨了如何实施empty
,zeros
和zeros_like
。
我只是cython
的初学者,但我必须使用:
tmp_buffer.data = <char *>my_buffer
如何以另一种方式进行,my_buffer
分配data
tmp_buffer
?
array1 = np.empty(bsize, dtype=int)
cdef int *data
data = <int *> array1.data
for i in range(bsize):
data[i] = bsize-data[i]
http://gael-varoquaux.info/programming/cython-example-of-exposing-c-computed-arrays-in-python-without-data-copies.html
建议使用np.PyArray_SimpleNewFromData
从现有数据缓冲区创建数组。
关于记忆观点 http://docs.cython.org/src/userguide/memoryviews.html