我正在尝试使用MPI在集群上运行作业（python代码）。每个节点上有63GB的可用内存。 当我在一个节点上运行它时，我指定PBS参数（此处仅列出相关参数）：
#PBS -l mem=60GB
#PBS -l nodes=node01.cluster:ppn=32
time mpiexec -n 32 python code.py
比工作得好。
由于PBS手册页说mem是每个整个作业的内存，我尝试在两个节点上运行它时的参数是
#PBS -l mem=120GB
#PBS -l nodes=node01.cluster:ppn=32+node02.cluster:ppn=32
time mpiexec -n 64 python code.py
这不起作用（qsub: Job exceeds queue resource limits MSG=cannot satisfy queue max mem requirement）。即使我设置mem=70GB（例如系统需要更多内存），它也会失败。
如果我在尝试使用两个节点时设置mem=60GB，我会得到
=>> PBS: job killed: mem job total xx kb exceeded limit yy kb.
我也尝试使用pmem（pmem=1875MB），但没有成功。
我的问题是：如何使用整个120GB的内存？
答案 0 :(得分：2)
Torque / PBS忽略mem资源，除非作业使用单个节点（参见here）：
作业使用的最大物理内存量。 （在Darwin，Digital Unix，Free BSD，HPUX 11，IRIX，NetBSD和SunOS上忽略。如果节点数不是1，则在Linux上也会被忽略。在AIX和HPUX 10上未实现。）< / p>
您应该使用限制每个作业进程的内存的pmem资源。使用ppn=32时，您应将pmem设置为1920MB，以便每个节点获得60 GB。在这种情况下，您应该注意pmem不允许在节点上运行的进程之间以mem的方式灵活地分配内存（因为后者被视为聚合值而pmem }适用于每个流程。）