我正在使用PBS，HPC提交串行写入的C代码。我必须在5个不同的目录中运行5个代码。当我选择1个节点和5个核心时 select = 1：ncpus = 5 ，并使用 ./ submit＆提交。它分叉并运行所有5个作业。我选择5个节点和1个核心的时刻， select = 5：ncpus = 1 ，然后使用 ./ submit＆提交。第一个节点中只有1个核心可以运行所有5个作业，其余4个线程可用，速度降低到1/5。
我的问题是，是否也可以在节点之间分叉作业？ 因为当我在HPC上选择 select = 1：ncpus = 24 时，它将进入Que而不是 select = 4：ncpus = 6 运行。 谢谢。
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您应该考虑将作业阵列（使用选项#PBS -t 1-5）与I节点和1个CPU一起使用。然后5个独立的作业将开始，您的作业将在队列中等待的时间更少。
在脚本内，您可以使用环境变量PBS_ARRAYID来识别任务，并使用它来设置适当的目录并启动适当的C代码。像这样：
#!/bin/bash -l
#PBS -N yourjobname
#PBS -q yourqueue
#PBS -l nodes=1:ppn=1
#PBS -t 1-5
./myprog-${PBS_ARRAYID}.c
此脚本将运行5个作业，每个作业将运行名为myprog-*。c的程序，其中*是介于1到5之间的数字。