如何使用dplyr扫描特定列?

时间:2015-02-03 12:15:35

标签: r dplyr

我的数据类型的一个非常常见的操作是将标准化因子应用于所有列。这可以使用sweepscale

高效完成
normalized = scale(data, center = FALSE, scale = factors)
# or
normalized = sweep(data, 2, factors, `/`)

其中

data = structure(list(A = c(3L, 174L, 6L, 1377L, 537L, 173L),
    B = c(1L, 128L, 2L, 1019L, 424L, 139L),
    C = c(3L, 66L, 2L, 250L, 129L, 40L),
    D = c(4L, 57L, 4L, 251L, 124L, 38L)),
    .Names = c("A", "B", "C", "D"),
    class = c("tbl_df", "data.frame"), row.names = c(NA, -6L))

factors = c(A = 1, B = 1.2, C = 0.8, D = 0.75)

但是,当我的数据前面有其他列时,如何使用dplyr执行此操作?我可以在单独的语句中执行此操作,但我想在一个管道中执行此操作。这是我的数据:

data = structure(list(ID = c(1, 2, 3, 4, 5, 6),
    Type = c("X", "X", "X", "Y", "Y", "Y"),
    A = c(3L, 174L, 6L, 1377L, 537L, 173L),
    B = c(1L, 128L, 2L, 1019L, 424L, 139L),
    C = c(3L, 66L, 2L, 250L, 129L, 40L),
    D = c(4L, 57L, 4L, 251L, 124L, 38L)),
    .Names = c("ID", "Type", "A", "B", "C", "D"),
    class = c("tbl_df", "data.frame"), row.names = c(NA, -6L))

我想在不触及前两列的情况下改变数据列。通常我可以使用mutate_each执行此操作;但是,我怎么不能将我的规范化因子传递给该函数:

data %>% mutate_each(funs(. / factors), A:D)

不出所料,我假设我想将每列除以factors,而不是按每个列除以匹配因子。

2 个答案:

答案 0 :(得分:11)

鉴于akrun的鼓励,让我在这里发布我所做的答案。我只是直觉地认为您可能要求R指出具有相同名称的列来执行此操作mutate_each。例如,如果.表示列A,我认为来自另一个data.frame的另一列A可能是dplyr可能喜欢的内容。因此,我为factors创建了一个数据框,然后使用了mutate_each。结果似乎是正确的。由于我没有技术背景,我担心我无法提供任何解释。我希望你不介意。

factors <- data.frame(A = 1, B = 1.2, C = 0.8, D = 0.75)

mutate_at(data, vars(A:D), funs(. / foo$.))

# By the time I answered this question, the following was working.
# But mutate_each() is now deprecated.

# mutate_each(data, funs(. / factors$.), A:D)

#  ID Type    A           B      C          D
#1  1    X    3   0.8333333   3.75   5.333333
#2  2    X  174 106.6666667  82.50  76.000000
#3  3    X    6   1.6666667   2.50   5.333333
#4  4    Y 1377 849.1666667 312.50 334.666667
#5  5    Y  537 353.3333333 161.25 165.333333
#6  6    Y  173 115.8333333  50.00  50.666667

修改

这也有效。鉴于数据框是列表的一个特例,这也许并不令人惊讶。

# Experiment
foo <- list(A = 1, B = 1.2, C = 0.8, D = 0.75)

mutate_at(data, vars(A:D), funs(. / foo$.))

# mutate_each(data, funs(. / foo$.), A:D)

#  ID Type    A           B      C          D
#1  1    X    3   0.8333333   3.75   5.333333
#2  2    X  174 106.6666667  82.50  76.000000
#3  3    X    6   1.6666667   2.50   5.333333
#4  4    Y 1377 849.1666667 312.50 334.666667
#5  5    Y  537 353.3333333 161.25 165.333333
#6  6    Y  173 115.8333333  50.00  50.666667

答案 1 :(得分:1)

dplyr 1.0.0中,您可以执行以下操作:

data %>%
 rowwise() %>%
 mutate(across(A:D)/factors)

     ID Type      A       B      C      D
  <dbl> <chr> <dbl>   <dbl>  <dbl>  <dbl>
1     1 X         3   0.833   3.75   5.33
2     2 X       174 107.     82.5   76   
3     3 X         6   1.67    2.5    5.33
4     4 Y      1377 849.    312.   335.  
5     5 Y       537 353.    161.   165.  
6     6 Y       173 116.     50     50.7