邻居错误“Erreur dans as.igraph.vs(graph,v):无效的顶点名称”

时间:2015-01-26 10:32:37

标签: r graph

使用igraph图,我有一个图g1节点的数据框,

DC1<-data.frame(
node=V(g1)$name,
Frequency=DC1$'DC')
DC2<-DC1[order(-DC1$'Frequency'),]

我使用循环,在每一步我都采用数据帧的第一个节点。对于这个节点,我计算它的邻居,然后从图形和数据框中删除它和它的邻居。

问题是在某个步骤我有这个消息`

Erreur dans as.igraph.vs(graph,v):无效的顶点名称.

当我试图知道原因时,我发现在这一步算法不能读取数据帧的第一行,所以我不能让邻居继续这个过程。

while(length(get.edgelist(g1))>0){

 v<-DC2$node[(order(-DC2$'Frequency'))]
 L<-V(g1)[V(g1)$name==v[1]]

 Nei <- neighbors(g1,L,1)

}

问题在于:

 > v<-DC2$node[(order(-DC2$'frequency')) ]
   > L<-V(g1)[V(g1)$name==v[1]]
   > L
  Vertex sequence:
  [1] "125"
  > Nei <- neighbors(g1,L,1)
  > Nei
  numeric(0)  

当我将L替换为其值时,其工作原理为:

  > Nei <- neighbors(g1,125,1)
   > Nei
   [1]   28   30   76 1883

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