我正在开发一组python脚本来预处理数据集,然后使用scikit-learn生成一系列机器学习模型。我想开发一组单元测试来检查数据预处理函数,并希望能够使用一个小的测试pandas数据帧,我可以为其确定答案并在断言语句中使用它。
我似乎无法加载数据帧并使用self将其传递给单元测试。我的代码看起来像这样;
def setUp(self):
TEST_INPUT_DIR = 'data/'
test_file_name = 'testdata.csv'
try:
data = pd.read_csv(INPUT_DIR + test_file_name,
sep = ',',
header = 0)
except IOError:
print 'cannot open file'
self.fixture = data
def tearDown(self):
del self.fixture
def test1(self):
self.assertEqual(somefunction(self.fixture), somevalue)
if __name__ == '__main__':
unittest.main()
感谢您的帮助。
答案 0 :(得分:20)
Pandas有一些测试工具。
import unittest
import pandas as pd
from pandas.util.testing import assert_frame_equal # <-- for testing dataframes
class DFTests(unittest.TestCase):
""" class for running unittests """
def setUp(self):
""" Your setUp """
TEST_INPUT_DIR = 'data/'
test_file_name = 'testdata.csv'
try:
data = pd.read_csv(INPUT_DIR + test_file_name,
sep = ',',
header = 0)
except IOError:
print 'cannot open file'
self.fixture = data
def test_dataFrame_constructedAsExpected(self):
""" Test that the dataframe read in equals what you expect"""
foo = pd.DataFrame()
assert_frame_equal(self.fixture, foo)
答案 1 :(得分:9)
如果您使用最新的熊猫,我认为以下方式更清洁:
import pandas as pd
pd.testing.assert_frame_equal(my_df, expected_df)
pd.testing.assert_series_equal(my_series, expected_series)
pd.testing.assert_index_equal(my_index, expected_index)
如果这些函数不等于&#34;那么这些函数中的每一个都会引发AssertionError
。
答案 2 :(得分:0)
您也可以使用snapshottest
做类似的事情。