qsub可以用qsub调用脚本(递归)吗?

时间:2015-01-12 15:22:35

标签: bash recursion qsub torque

我正在尝试编写一个使用qsub的递归脚本,但是在第一次迭代后我遇到了错误。包装器脚本位于perl(script.pl)中,看起来像这样:

script.pl
# creates doONE.sh containing various jobs
# creates submitQSUB.sh
exit 1

less submitQSUB.sh
FIRST=`qsub doONE.sh`
SECOND=`qsub depend=afterok:$FIRST script.sh`

在script.sh处于保持状态时,doONE.sh已正确提交并执行(这样可以正常工作)。但是,在尝试执行script.sh时,看起来集群会出现弹道。 我得到一个奇怪的错误,看起来像这样:

连接到trqauthd(15096)时出错 - [无法连接到unix socket / tmp / trqauthd-unix:111] 与clusterhn.cluster.com通信时出错(172.16.33.254) 沟通失败。

我已经尝试了所有可能的工作,我可以想到没有成功。 任何输入都是一个huuuuuge的帮助,可以让我恢复理智: - (

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