将csv读入年份,dayofyear和hour / min的索引到pandas datetime对象中

时间:2014-12-28 05:37:05

标签: datetime csv pandas julian-date

我试图以这种形式阅读csv:

2014,92,1931,6.234,10.14
2014,92,1932,5.823,9.49
2014,92,1933,5.33,7.65
2014,92,1934,4.751,6.19
2014,92,1935,4.156,5.285
2014,92,1936,3.962,4.652
2014,92,1937,3.74,4.314
2014,92,1938,3.325,3.98
2014,92,1939,2.909,3.847
2014,92,1940,2.878,3.164

要明确的是,这是(年,一年中,每小时2400小时,以及两列值)。

我在前一个问题中对此问题有过一些想法,但无济于事,事实证明这是一个问题......(Create an indexed datetime from date/time info in 3 columns using pandas

如上述问题所述,以下内容" read_csv"尝试

df = pd.read_csv("home_prepped.dat", parse_dates={"dt" : [0,1,2]}, 
                  date_parser=parser, header=None)

触发TypeError:

TypeError: parser() takes exactly 1 argument (3 given) 

这是由于" parse_dates" arg有0,1,2。 我也尝试将它们放在双括号[[0,1,2]]中并得到:

ValueError: [0, 1, 2] is not in list

我已经通过设置parse_dates = True来解决这个问题,并认为我可以在之后使用set_index但是得到这个:

TypeError:必须是字符串,而不是numpy.int64

我的解析器也被格式化了,而且我已经阅读了关于零填充的相互矛盾的故事"一年中的#34;值。我不是零填充,但即便如此,除了错误之外,我已经将格式挂在第一个值,即年份!这是解析器:

def parser(x):
    return pd.datetime.strptime(x, '%Y %j %H%M')

所以,我有错误说' 2014'不承认,并且' 92' (一年中的某一天)没有被承认,但是受到了鼓励,因为至少strptime已经能够通过"通过"试试这种格式。

我想知道这是否与我的数据有关。

我正在寻找一种方法来将这个日期时间信息编入索引作为日期时间,除了问题我什么都没有。我已经继续并填补了一些julians,以防有人想测试格式是填充问题,见下文:

2014,092,1931,6.234,10.14
2014,092,1932,5.823,9.49
2014,092,1933,5.33,7.65
2014,092,1934,4.751,6.19
2014,092,1935,4.156,5.285
2014,092,1936,3.962,4.652
2014,092,1937,3.74,4.314
2014,092,1938,3.325,3.98
2014,092,1939,2.909,3.847
2014,092,1940,2.878,3.164

感谢您的帮助,我开始真的感到沮丧:S

2 个答案:

答案 0 :(得分:1)

%m(月)更正为%M(分钟)后,您的代码适用于我:

>>> import pandas as pd
>>> print pd.version.version
0.15.2-10-gf7af818
>>> 
>>> def parser(x):
...         return pd.datetime.strptime(x, '%Y %j %H%M')
... 
>>> df = pd.read_csv("home_prepped.dat", parse_dates={"dt" : [0,1,2]}, 
...                  date_parser=parser, header=None)
>>> df
                   dt      3       4
0 2014-04-02 19:31:00  6.234  10.140
1 2014-04-02 19:32:00  5.823   9.490
2 2014-04-02 19:33:00  5.330   7.650
3 2014-04-02 19:34:00  4.751   6.190
4 2014-04-02 19:35:00  4.156   5.285
5 2014-04-02 19:36:00  3.962   4.652
6 2014-04-02 19:37:00  3.740   4.314
7 2014-04-02 19:38:00  3.325   3.980
8 2014-04-02 19:39:00  2.909   3.847
9 2014-04-02 19:40:00  2.878   3.164

但是在玩了一会儿之后,当发生错误时会有一些非常奇怪的行为,导致一些奇怪的错误信息,所以我可以看出为什么调试这个很难。


如果出于某种原因上述情况不起作用,您可以尝试自己进行解析:

df = pd.read_csv("home_prepped.dat", header=None)
timestr = df.iloc[:,:3].astype(str).apply(' '.join,axis=1)
df = df.iloc[:,3:]
times = pd.to_datetime(timestr, format='%Y %j %H%M')
df["dt"] = times

如上所述,当出现问题(例如解析错误)时,错误消息在read_csv内非常混乱。

答案 1 :(得分:1)

我认为以下似乎有效。请记住,这是我第一次携带任何东西进入大熊猫工作,所以不确定如何正确测试它,但它识别格式并说:

<class 'pandas.tseries.index.DatetimeIndex'>
[2014-04-02 19:31:00, ..., 2014-12-21 23:59:00]
Length: 337917, Freq: None, Timezone: None

哪个很好,因为我相信这意味着我最终索引了一个日期时间!

这就是我做的......

In [41]:

import numpy as np
import pandas as pd
from datetime import datetime
In [60]:

def parse(yr, yearday, hrmn):
          date_string = ''.join([yr, yearday, hrmn])
          return datetime.strptime(date_string,"%Y%j%H%M")
In [61]:


df = pd.read_csv('home_prepped.csv', parse_dates={'datetime':[0,1,2]}, date_parser=parse, index_col='datetime', header=None)

现在我试图在&#39;&#39;之间留一个空格。在.join之前它将%Y%j分开,但只能看到&#34; 1&#34;作为%H的一部分。所以我摆脱了空间,并将格式改为无空间。

感谢您在此DSM上的工作。