如何在热图的y轴旁边添加箭头来标记R中感兴趣的特定基因?

时间:2014-12-24 10:02:10

标签: r expression heatmap

我知道如何创建热图,但我想在特定行上的我感兴趣的基因旁边添加一个箭头。我看到一些有箭头的热图,但我无法找到解决方案。 这是我使用heatmap.3的热图代码:

heatmap.3(as.matrix(exprs(df)),keysize = 1, Colv=T,Rowv=F,main = "My heatmap", 
 ColSideColors=Col.matrix,side.height.fraction=0.5,col=my.colors, 
  dendrogram="column", scale="none",  breaks=my.breaks, key=TRUE)

以下是如何使用heatmap.3包绘制热图的示例。

  ## load library
  require("GMD")
  require(cluster)
  ## load data
  data(ruspini)
  ## heatmap on a `dist' object
  x <- gdist(ruspini)
  main <- "Heatmap of Ruspini data"
  dev.new(width=10,height=10)
  heatmap.3(x, main=main) # with a title and a map in square!

这里是另一个热图的链接,可以看到我要找的东西,在热图旁边添加一个箭头。如果你看热图,你可以在热图的y轴旁找到两个箭头。

本文中的内容: Veillonella,Firmicutes:Microbes disguised as Gram negatives,doi:10.4056 / sigs.2981345

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