我知道如何创建热图,但我想在特定行上的我感兴趣的基因旁边添加一个箭头。我看到一些有箭头的热图,但我无法找到解决方案。 这是我使用heatmap.3的热图代码:
heatmap.3(as.matrix(exprs(df)),keysize = 1, Colv=T,Rowv=F,main = "My heatmap",
ColSideColors=Col.matrix,side.height.fraction=0.5,col=my.colors,
dendrogram="column", scale="none", breaks=my.breaks, key=TRUE)
以下是如何使用heatmap.3包绘制热图的示例。
## load library
require("GMD")
require(cluster)
## load data
data(ruspini)
## heatmap on a `dist' object
x <- gdist(ruspini)
main <- "Heatmap of Ruspini data"
dev.new(width=10,height=10)
heatmap.3(x, main=main) # with a title and a map in square!
这里是另一个热图的链接,可以看到我要找的东西,在热图旁边添加一个箭头。如果你看热图,你可以在热图的y轴旁找到两个箭头。
本文中的内容: Veillonella,Firmicutes:Microbes disguised as Gram negatives,doi:10.4056 / sigs.2981345