使用matplotlib Polycollection绘制来自csv文件的数据

Question

我一直在尝试使用与此相似的PolyCollection制作图表： http://matplotlib.org/examples/mplot3d/polys3d_demo.html

不同之处在于，我希望我的代码能够从文件夹中读取所有CSV文件并在其中绘制数据（而不是随机数）。每个CSV文件包含一个频谱，即两列和一定数量的行。我希望第一行是我的x值，第二行是相应的z值。

我试过了：

import os
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib.collections import PolyCollection

fig=plt.figure()
ax = fig.gca(projection='3d')

input_path = 'input'         
spectrumfiles = []
verts=[]

for root, dirs, files in os.walk(input_path):    
    for name in files:
        if os.path.splitext(name)[1] == '.CSV' or os.path.splitext(name)[1] == '.csv':
            spectrumfiles.append(os.path.join(root,name)) 

zs = np.arange(len(files))                            

for name in spectrumfiles:
    spectrum = np.loadtxt(name, delimiter=',')
    #xs = spectrum[:,0]                   #I tried this first but then realised that "spectrum
    #ys = spectrum[:,1]                   #already has the needed shape               
    #verts.append(list(zip(xs,ys)))

    verts.append(spectrum)



poly = PolyCollection(verts, facecolors=np.ones(len(verts)))      #I'm not too bothered with
poly.set_alpha(0.7)                                               #colours at the moment
ax.add_collection3d(poly, zs=zs, zdir='y')

plt.show()

现在，我得到的图表是空的。

编辑： 这里有4个样本FILES

EDIT2： 这里有一些关于stackoverflow的相关问题的链接。   - Matplotlib plot pulse propagation in 3d   - Waterfall plot python?

Answer 1

好的，轻松修复 - 您唯一的问题是因为您自己将PolyCollection添加到轴上，它不会自动将x / y / z限制缩放到适当的值（仍然显示在0和1之间）。对于您拥有的数据，如果添加以下行：

ax.set_xlim(0,5000)
ax.set_ylim(0,len(spectrumfiles))

然后你的数据会神奇地出现。