matplotlib的pcolor中的白线

Question

在一些pdf查看器中，例如在OSX上预览，使用matplotlib的pcolor制作的图表有白线（见下图）。我该怎样摆脱它们？

源代码非常简单（选择x，y，z的所有数据）：

import matplotlib
matplotlib.use("pdf")
import matplotlib.pyplot as pl
pl.figure()
pl.pcolormesh(x,y,z,cmap="Blues",linewidth=0) 
pl.savefig("heatmap.pdf")

Answer 1

评论有一个很好的解决方案，利用imshow。当imshow不适合输入数据时（例如，它不是均匀间隔），这通常可以解决这个问题，

pcol = pl.pcolormesh(x,y,z,cmap="Blues",linewidth=0,)
pcol.set_edgecolor('face')

如果这种方法不能充分减少线条，你也可以试试这个：

pl.pcolormesh(x,y,z,cmap="Blues",linewidth=0,rasterized=True)

除了减少方块之间的线条之外，这种方法还倾向于稍微减小文件大小，这有时是有用的。在这种情况下，您可能希望在保存时调整dpi设置（例如pl.savefig("heatmap.pdf", dpi=300)），直到您获得满意的效果。

Answer 2

我遇到了这个问题，使用rasterized=True解决了这个问题（在ma​​tplotlib版本3.1.0上）。

Answer 3

基于@eqzx 的回答： 如果您设置 alpha=1，就网格线而言，您将获得更好的结果。但是，您的应用程序/用例可能会有所不同。

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
x = np.linspace(0, 10, 100)
y = np.linspace(0, 10, 100)
xx, yy = np.meshgrid(x, y)

zz = xx**2 + yy*2
fig, axes = plt.subplots(2,3, figsize=(15,5))
axes[0,0].pcolormesh(XX, YY, ZZ_r, zorder=-1, cmap='magma', alpha=0.5, antialiased=True)
axes[0,1].pcolormesh(XX, YY, ZZ_r, zorder=-1, cmap='magma', alpha=0.5, antialiased=True, linewidth=0.0)
axes[0,2].pcolormesh(XX, YY, ZZ_r, zorder=-1, cmap='magma', alpha=0.5, antialiased=False, linewidth=0.0)
axes[1,0].pcolormesh(XX, YY, ZZ_r, zorder=-1, cmap='magma', alpha=1, antialiased=True)
axes[1,1].pcolormesh(XX, YY, ZZ_r, zorder=-1, cmap='magma', alpha=1, antialiased=True, linewidth=0.0)
axes[1,2].pcolormesh(XX, YY, ZZ_r, zorder=-1, cmap='magma', alpha=1, antialiased=False, linewidth=0.0)

See plot here

Answer 4

被接受的答案对我来说不是很好。除antialiased=True外，我似乎还通过使用linewidth=0越来越近了。这是与matplotlib版本3.0.2一起使用的。请注意，中间的图对应于最佳版本。

fig, axes = plt.subplots(1,3, figsize=(15,5))
axes[0].pcolormesh(XX, YY, ZZ_r, zorder=-1, norm=norm, cmap='magma', alpha=0.5, antialiased=True)
axes[1].pcolormesh(XX, YY, ZZ_r, zorder=-1, norm=norm, cmap='magma', alpha=0.5, antialiased=True, linewidth=0.0)
axes[2].pcolormesh(XX, YY, ZZ_r, zorder=-1, norm=norm, cmap='magma', alpha=0.5, antialiased=False, linewidth=0.0)