消除Matplotlib / Basemap pcolor图中的白边

时间:2012-11-28 13:34:36

标签: python numpy matplotlib matplotlib-basemap

我正在使用以下代码在地图上绘制数据:

import numpy as np
import matplotlib as mpl
import matplotlib.pyplot as plt
import matplotlib.cm as cm
from mpl_toolkits.basemap import Basemap
from matplotlib.patches import Polygon
from scipy.io import netcdf

ncfile = netcdf.netcdf_file(myfile.nc,'r')
lon = ncfile.variables['longitude'][:]
lat = ncfile.variables['latitude'][:]
data = ncfile.variables['mydata'][:]
ncfile.close()

m = Basemap(projection='nplaea', boundinglat=40, lon_0=270)
m.drawcoastlines(linewidth=.6, zorder=2)
m.drawparallels(np.arange(-80.,81.,20.), zorder=1)
m.drawmeridians(np.arange(-180.,181.,20.), zorder=1)
cNorm = mpl.colors.Normalize(vmin=0, vmax=np.nanmax(data))
cmap = plt.get_cmap('jet')
lons, lats = np.meshgrid(lon, lat)
x, y = m(lons, lats)
datamap = m.pcolor(x, y, data, zorder=0)
datamap.set_norm(cNorm) 
plt.colorbar(datamap, cmap=cmap, norm=cNorm, shrink=0.5)
plt.savefig('figures/map_polar.png', dpi=150, bbox_inches='tight', pad_inches=0.4)

这会生成此图片:enter image description here

如您所见,网格单元之间存在白色间隙。我该怎样摆脱它们?

3 个答案:

答案 0 :(得分:3)

我知道这是一个老问题,但我想我会为这个问题添加解决方案。当我遇到与你的问题完全相同的问题时,我发现了你的问题,即我的情节中的白线和从-180到180的网格。我的解决方案是使用底图函数addcyclic

from mpl_toolkits.basemap import Basemap, shiftgrid, addcyclic
SSTcyclic, lonCMIP5cyclic = addcyclic(SST, lonCMIP5)

这解决了我的问题。干杯,特隆德

答案 1 :(得分:2)

我曾经遇到过同样的问题。问题很可能出在longitude。 确保输入中存在0360。如果没有,请手动添加它们,然后 相应地更改mydata,使它们具有相同的形状。

答案 2 :(得分:2)

我觉得原来的帖子实际上并没有询问0360度之间的白色区域。

我认为OP正在谈论每个颜色方块之间的线条,这与this bug一致:

  

似乎savig对pdf格式的pcolor图总是包含网格线,但对于其他输出格式(如png

)则不然

以下是开发人员对此问题的看法:

  

我在gs,xpdf Preview.app中看到了生成图像中的网格线,但没有   在Adobe Reader中。当我放大预览时,线条跳了一下,   无论缩放级别如何,屏幕上的宽度始终相同。

     

在这个例子中绘制的是很多多边形,所以相邻   多边形与完全相同的坐标共享边。代码填写   每个多边形的内部,显然是一些渲染算法   在多边形之间留下最小宽度线。

所以这是PDF查看器的问题,而不是pcolormatplotlib的任何其他方面。