随机林中的tuneGrid参数问题

时间:2014-11-12 02:38:52

标签: r random-forest r-caret

我一直在处理一些非常不平衡的数据,我想使用分层抽样来创建更平衡的随机森林

现在,我正在使用插入包,主要用于调整随机森林。 所以我尝试设置一个tuneGrid,将mtry和sampsize参数传递给插入符号列表方法,如下所示。

mtryGrid <- data.frame(.mtry = 100),.sampsize=80)
rfTune<- train(x = trainX,
               y = trainY,
               method = "rf",
               trControl = ctrl,
               metric = "Kappa",
               ntree = 1000,
               tuneGrid = mtryGrid,
               importance = TRUE)

当我运行此示例时,我收到以下错误

The tuning parameter grid should have columns mtry

我遇到像this这样的讨论,建议应该可以传入这些参数。

另一方面,这个page表明可以传入的唯一参数是mtry

我是否可以通过插入符号将sampsize传递到随机森林中?

1 个答案:

答案 0 :(得分:13)

您的mtryGrid似乎存在支架问题。或者,您也可以使用expand.grid来提供您想要尝试的mtry的不同值。 默认情况下,您可以为随机林调整的唯一参数是mtry。但是,您仍然可以将其他参数传递给train。但是这些将具有固定值,因此不会被train调整。但您仍然可以要求在train中使用分层样本。下面是我将如何做,假设trainY是一个布尔变量,您希望根据该变量对样本进行分层,并且您希望每个类别的样本大小为80:

mtryGrid <- expand.grid(mtry = 100) # you can put different values for mtry
rfTune<- train(x = trainX,
               y = trainY,
               method = "rf",
               trControl = ctrl,
               metric = "Kappa",
               ntree = 1000,
               tuneGrid = mtryGrid,
               strata = factor(trainY),
               sampsize = c(80, 80), 
               importance = TRUE)