如何用二元掩模提取感兴趣的区域

Question

我有原始的胸部X光图像（orig.jpg）。我用ITK-SNAP做了手动分割，产生了这个二元掩模图像（bmask.jpg）：

要从背景中提取肺部区域，请运行以下MATLAB代码：

clear all;
clc;
IR=imread('orig.jpg');
im=imread('bmask.jpg');
ROI = IR;
ROI(im == 1) = 0;
ROI(im ~= 1) = 1;
SEG = IR.*ROI;
figure;
imshow(SEG);
imwrite(SEG,'SEG.jpg');

结果图片：

我发现，因为在肺部边界附近的肺部区域内的二元面罩的一些像素具有＆＃34; 1＆＃34;值，所得图像在肺部区域内的肺部边界附近有一些黑点。而且，在得到的图像中，肺边界具有Z字形图案，而不是作为二元掩模的平滑图案。我该如何解决这些问题？有人可以帮助我吗？

感谢。

Answer 1

我猜你遇到的问题是因为你的jpg掩码不是真正的二进制图像。使用jpg来存储二进制图像并不是一个好主意，因为由于jpegs的压缩性质，你的掩码会略微偏离二进制图像，特别是在边缘。

要从你的jpeg面具中获取真正的二进制图像，你可以试试这个：

Ibw = im2bw(rgb2gray(imread('mask.jpg')));

如果没有帮助，当您生成面具时，请不要使用jpeg。相反，在灰度级中使用未压缩（或无损压缩）tiff，或者仅将其存储为文件中的二进制matlab矩阵。

希望这有帮助。

Answer 2

clear all;
clc;
IR=imread('orig.jpg');
im=imread('bmask.jpg'); %binary image
ROI = IR;
ROI(im == 0) = 0;
figure;
imshow(ROI);