Question

我的文件头部如下：

>PZ7180000000004_TX nReads=26 cov=9.436
>PZ7180000031590 nReads=3 cov=2.59465
>PZ7180000027934 nReads=5 cov=2.32231
>PZ456916 nReads=1 cov=1
>PZ7180000037718 nReads=9 cov=6.26448
>PZ7180000000004_TY nReads=86 cov=36.4238
>PZ7180000000067_AF nReads=16 cov=12.0608
>PZ7180000031591 nReads=4 cov=3.26022
>PZ7180000024036 nReads=14 cov=5.86079
>PZ15501_A nReads=1 cov=1

我想将字符串_nogroup添加到未指定_XX的每一行的第一列（即第一行的第一列是正常的，但是1st 2nd行上的列应为>PZ7180000031590_nogroup）。

我是否可以使用awk来使用命令行。

Answer 1

您可以使用此awk命令：

awk '!($1 ~ /_[a-zA-Z]{2}$/) {$1=$1 "_nogroup"} 1' file
>PZ7180000000004_TX nReads=26 cov=9.436
>PZ7180000031590_nogroup nReads=3 cov=2.59465
>PZ7180000027934_nogroup nReads=5 cov=2.32231
>PZ456916_nogroup nReads=1 cov=1
>PZ7180000037718_nogroup nReads=9 cov=6.26448
>PZ7180000000004_TY nReads=86 cov=36.4238
>PZ7180000000067_AF nReads=16 cov=12.0608
>PZ7180000031591_nogroup nReads=4 cov=3.26022
>PZ7180000024036_nogroup nReads=14 cov=5.86079
>PZ15501_A_nogroup nReads=1 cov=1

使用awk将字符串添加到第1列的末尾

1 个答案: