使用ggplot以对数刻度绘制具有x轴的函数

时间:2014-11-09 11:45:59

标签: r function ggplot2

我想使用ggplot2绘制一个函数(使用drc包中的drm()的结果),其中X轴是对数刻度。

我有这样的代码:

 library(ggplot2)

 args = list(A = 4.224536e+04, B = 1.335570e+00, C = 5.992606e-01, D = 2.341207e+04)
 LP.4 = function(x, B, D, A, C) {D + (A-D)/(1+(x/C)^B)}
 dose = as.numeric(rev(c(100, 5, 2, 1, 0.5 , 0.25 , 0.1 , 0.05, 0.01, 0.0001)))
 predicted = lapply(dose, LP.4, args$B, args$D, args$A, args$C)  
 df = data.frame(cbind(as.numeric(dose), as.numeric(predicted)))

 ggplot(df, aes(x=X1, y=X2)) + 
 scale_x_log10() + 
 geom_point()

我确切需要生成点和轴。

我正在尝试使用stat_function()这样的点来绘制函数:

 ggplot(data.frame(x=dose), aes(x)) + 
            scale_x_log10() + 
            stat_function(fun = LP.4, 
            args = list(A = 42245, B = 1.33, C = 0.599, D = 23412))

但我无法得到相同的结果。我做错了什么?

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

您的问题与此post中解决的问题类似。使用scale_x_log10,获取x的基数10日志,然后传递给stat_function进行评估。尝试以下内容:

LP.4mod <- function(x, ...) LP.4(10^x,... ) 
ggplot(data.frame(x=dose), aes(x)) + 
 scale_x_log10() + 
 stat_function(fun = LP.4mod, 
            args = list(A = 42245, B = 1.33, C = 0.599, D = 23412))