我喜欢在多个细节层面上提供研究的想法，即抽象的随意好奇，全文更感兴趣，最后是那些在同一区域工作的数据和代码/试图重现你的结果。在实际文本和数据/代码级别之间，我想插入另一个图层。也就是说，我想创建一种自动生成的附录，其中包含分析中的完整回归输出，诊断图，探索图数据配置文件等，无论 这些情节/回归等是否成为最终论文。
我的一个想法是编写一个脚本来自动检查.Rnw文件：
这个想法是让这种低成本，按键式的东西，而不是像纸张其余部分那样的正式附录。我正在寻找的是关于如何以相对简单的方式在R中执行此操作的一些想法。我的预感是有一些方法可以通过命名空间，弄清楚是什么，然后转储到PDF中。
思考？这样的事情已经存在吗？
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John，这听起来很有意思，但如果您提供数据并且文章格式化为sweave，那么这个长日志文件不会冗余吗？
回到你的问题，你可能想要查看的一个包是 zelig ，因为它“自动创建复制数据文件，以便你（或者，如果你愿意，任何人） else）可以复制你的分析结果（因此满足复制标准）“。不是你想要的，但复制数据文件的概念可能会给你一些其他的想法。请注意，多个日志现在正在使用复制数据文件。
答案 1 :(得分：1)
我们最近的JASA文章http://hdl.handle.net/1902.1/12174尝试了这一点。你应该能够“制作”整篇论文。关于我们的复制存档有一点需要注意：我们使用的R软件包的打包版本。事实证明，随着人们改进他们的包裹，有时他们会改变默认值 - 这会破坏我们的构建。也许将来可能会分发一个包含R二进制文件的整个虚拟机，这个虚拟机将被调用[回忆圆（x，digits =）丢失其参数并成为从R版本到下一个版本的位置 - 进行回合（数字=， x）在没有警告的情况下提供无意义的结果？]。
无论如何，这是我们对这样一个复杂文件的第一次尝试。我在这里有一个较小的版本http://hdl.handle.net/1902.1/13376，它不使用make。