如何将OpenBUGS Coda文件转换为R中的mcmc对象？

Question

我使用了OpenBUGS，它生成了MCMC输出的coda文件。要计算和绘制Gelman Rubin和Geweke诊断，我需要将此coda.odc文件转换为R中的mcmc对象？有没有办法做到这一点？或者，您是否建议我采用其他方式进行此分析？

由于

Answer 1

coda包中的read.coda，...类似于：

library(coda)
my.coda <- read.coda("Chain1.txt", "CODAIndex.txt")

可以使用.odc文件。如果您将CODA文件保存为OpenBUGS中的.txt，则可以正常工作 my.coda将是mcmc类型对象。