超时并杀死并行matlab执行

Question

我有一个matlab处理脚本，位于linux上运行的长处理管道中间。

matlab脚本通过N将相同的操作应用于（{8}个）并行的数D_i (i=1,2,...,N)个数据集parfor。 通常，处理整个数据集大约需要2小时（在8个核心上）。

不幸的是，有时看起来像其中一个matlab子进程随机崩溃。这使得工作无法完成（管道无法完成）。

我确信这不依赖于数据，就好像我专门重新处理进程崩溃的D_i一样，执行时没有问题。此外，到目前为止，我已经处理了数以千计的数据集。

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我现在如何解决问题（......手动......）：

启动matlab作业后，我会定期检查机器上的进程列表（通过简单的top）;每当我在两个小时的工作后有一个matlab进程存活，那么我肯定知道它已经崩溃了。然后我简单地将其杀死并处理尚未分析的数据集部分。

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问题：

我正在寻找关于如何超时所有运行的matlab进程的建议，并在它们活着时杀死它们超过例如2小时CPU。

Answer 1

您应该可以通过重构代码来使用PARFEVAL而不是PARFOR来实现此目的。 Loren的博客中有一个简单的例子：http://blogs.mathworks.com/loren/2013/12/09/getting-data-from-a-web-api-in-parallel/，它展示了如何在一段时间后停止等待工作。