如何grep @符号后面的行?
我虽然这应该有效:grep -A @ file
@SRR797059.1 HWIEAS269_0001:5:1:1049:4995 length=38
CGAGCTCCGGCTCGGAGGACCATACTATCGTATGCNGN
+SRR797059.1 HWIEAS269_0001:5:1:1049:4995 length=38
bbbbbbbbbbbbbb^bb]_^aR_]_b_b[_BBBBBBBB
@SRR797059.2 HWIEAS269_0001:5:1:1057:20746 length=38
GGATCTGTAAACATCCTCGACTGGAAGCTTACTATCGT
输出
CGAGCTCCGGCTCGGAGGACCATACTATCGTATGCNGN
GGATCTGTAAACATCCTCGACTGGAAGCTTACTATCGT
答案 0 :(得分:1)
-A
选项后面需要一个数字,表示您需要打印的行数。
来自man
页面:
> -A num, --after-context=num
> Print num lines of trailing context after each match.
所以你应该尝试:
$ grep -A 1 '@' file
@SRR797059.1 HWIEAS269_0001:5:1:1049:4995 length=38
CGAGCTCCGGCTCGGAGGACCATACTATCGTATGCNGN
--
@SRR797059.2 HWIEAS269_0001:5:1:1057:20746 length=38
GGATCTGTAAACATCCTCGACTGGAAGCTTACTATCGT
$ awk 'p;{p=(/@/?1:0)}' file
CGAGCTCCGGCTCGGAGGACCATACTATCGTATGCNGN
GGATCTGTAAACATCCTCGACTGGAAGCTTACTATCGT
设置包含@
的行的标志。打印下一行并禁用它。