我的输入数据如下:
AA 36C 37T 38T
36C 17935 3349 16843
37T 3349 4 5690
38T 16843 5690 11
我希望以我拥有nxn图块的方式可视化数据,并且图块(0,0)的颜色将基于联系人36C-36C的数字(在这种情况下为17935),图块(0) ,1)基于联系人36C-37T的数量等。我认为geom_tile
应该完成这项工作,但我不知道该怎么做。
当我读到数据时,我得到了
data = read.table(" test.tbl",header = T)
> str(data)
'data.frame': 3 obs. of 4 variables:
$ AA : Factor w/ 3 levels "36C","37T","38T": 1 2 3
$ X36C: int 17935 3349 16843
$ X37T: int 3349 4 5690
$ X38T: int 16843 5690 11
之后我不知道如何继续并告诉ggplot绘制矩阵。谢谢你的帮助。
答案 0 :(得分:2)
抱歉,在询问之前应该做更多的研究。
它通过融化数据框架起作用。
> library(reshape2)
> melt(data)
Using AA as id variables
AA variable value
1 36C X36C 17935
2 37T X36C 3349
3 38T X36C 16843
4 36C X37T 3349
5 37T X37T 4
6 38T X37T 5690
7 36C X38T 16843
8 37T X38T 5690
9 38T X38T 11
ggplot(data_new, aes(x = variable, y = AA)) + geom_tile(aes(fill = value))
然后提供所需的结果。