如何使用Knitr将.Rmd文件中的每个块清除为多个.R文件

时间:2014-09-12 04:12:47

标签: r knitr

我们可以将.Rmd文件清除为.R文件,但是如何清除.Rmd文件中的每个块以分隔由块标记命名的.R文件。

1 个答案:

答案 0 :(得分:3)

假设您有以下.Rmd文档,名为" test.Rmd":

This is a test.

```{r chunk1}
1:4
```

This is a further test.

```{r chunk2}
5:6
```

如果purl - ed,您会收到以下信息:

## ----chunk1--------------------------------------------------------------
1:4


## ----chunk2--------------------------------------------------------------
5:6

首先使用purl,使用read_chunk函数,然后将每个块写入单独的文件,您可以将其放入单独的文件中:

library("knitr")
p <- purl("test.Rmd")
read_chunk(p)
chunks <- knitr:::knit_code$get()
invisible(mapply(function(chunk, name) {
    writeLines(c(paste0("## ----",name,"----"), chunk), paste0("chunk-",name,".R"))
}, chunks, names(chunks)))
unlink(p) # delete the original purl script
knitr:::knit_code$restore() # remove chunks from current knitr session

这会为每个名为"chunk-chunk1.R""chunk-chunk2.R"等的块生成一个文件,其中只包含该块的代码。