在numpy数组中查找相同的行和列

时间:2014-08-27 17:00:31

标签: python arrays numpy

我有一个nxn元素的bolean数组,我想检查是否有任何行与另一行相同。如果有任何相同的行,我想检查相应的列是否也相同。

以下是一个例子:

A=np.array([[0, 1, 0, 0, 0, 1],
            [0, 0, 0, 1, 0, 1],
            [0, 1, 0, 0, 0, 1],
            [1, 0, 1, 0, 1, 1],
            [1, 1, 1, 0, 0, 0],
            [0, 1, 0, 1, 0, 1]])

我希望程序找到第一行和第三行相同,然后检查第一列和第三列是否也相同;在这种情况下,他们是。

4 个答案:

答案 0 :(得分:4)

您可以使用np.array_equal()

for i in range(len(A)): #generate pairs
    for j in range(i+1,len(A)): 
        if np.array_equal(A[i],A[j]): #compare rows
            if np.array_equal(A[:,i],A[:,j]): #compare columns
                print (i, j),
        else: pass

或使用combinations()

import itertools

for pair in itertools.combinations(range(len(A)),2):
    if np.array_equal(A[pair[0]],A[pair[1]]) and np.array_equal(A[:,pair[0]],A[:,pair[1]]): #compare columns
        print pair

答案 1 :(得分:2)

从将np.unique应用于2D数组并让它返回唯一对的典型方法开始:

def unique_pairs(arr):
    uview = np.ascontiguousarray(arr).view(np.dtype((np.void, arr.dtype.itemsize * arr.shape[1])))
    uvals, uidx = np.unique(uview, return_inverse=True)
    pos = np.where(np.bincount(uidx) == 2)[0]

    pairs = []
    for p in pos:
        pairs.append(np.where(uidx==p)[0])

    return np.array(pairs)

然后我们可以执行以下操作:

row_pairs = unique_pairs(A)
col_pairs = unique_pairs(A.T)

for pair in row_pairs:
    if np.any(np.all(pair==col_pairs, axis=1)):
        print pair

>>> [0 2]

当然还有很多优化要做,但重点是使用np.unique。与其他方法相比,此方法的效率在很大程度上取决于您如何定义“小”数组。

答案 2 :(得分:1)

既然你说性能并不重要,那么这里就是一个不那么笨拙的蛮力解决方案:

>>> n = len(A)
>>> for i1, row1 in enumerate(A):
...     offset = i1 + 1  # skip rows already compared 
...     for i2, row2 in enumerate(A[offset:], start=offset):
...         if (row1 == row2).all() and (A.T[i1] == A.T[i2]).all():
...             print i1, i2
...             
0 2

可能是O(n ^ 2)。我使用转置数组A.T来检查列相等。

答案 3 :(得分:1)

对于小数组,另一种不依赖 Python 循环的方法是通过 NumPy 广播。

bool_array = np.logical_not(np.logical_xor(A[:,np.newaxis,:], A[np.newaxis,:,:])) # XNOR for comparison
matches_array = np.sum(bool_array, axis=2)  # count total matches for all elements in a row
row1, row2 = np.where(matches_array == A.shape[1]) # identical row = all elements in a row match
row1, row2 = row1[row2 > row1], row2[row2 > row1]  # filter self & duplicated comparisons
column_match = np.all(A[:,row1] == A[:,row2], axis=0)  # check if the corresponding columns are identical
for r1, r2, c in zip(row1, row2, column_match):
    print("Row %d and row %d : Column identical: %s" % (r1, r2, c))

如前所述,当A变大时,这种方法不起作用,因为它在计算过程中需要O(n^3)的内存存储(由于bool_array