用R标记基因组区域

时间:2014-08-27 16:46:00

标签: r annotations regions

我有一些基因组区域,它们的染色体数目是已知的(它们在哪个链上),它们看起来像:

chr12   32264360        32264363        par_30_2_100_human      4       +
chr20   99393247        99393251        par_30_2_100_human      5       +
chr22   13255328        23255329        par_30_2_100_human      2       +

我想通过使用此信息对它们进行注释,但我无法将它们转换为BiomaRt所需的格式(我是R中的新用户)。

你可能知道如何注释它们吗?

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