绘制R中的标准误差

Question

我有关于某些鱼类捕获率的数据。

fish 1  fish 2  fish 3
0.000   3.265   9.872
2.147   1.013   0.000

我使用以下方法计算了每条鱼的平均捕获率：

a <- colMeans(df)

我还计算了标准误差：

stdError <- (sapply(df,sd))/sqrt(length(df))

我使用以下方法创建了一个dotplot：

dotplot(a, xlab="mean catch", ylab = "species",las =2,)

如何在此图中添加误差线？如果可能的话，我宁愿不使用ggplot。我目前正在使用R中的内置函数，但可以访问莱迪思。

对不起可能是一个基本问题，我对R中的情节完全是新的。

Answer 1

dotplot是一个点阵函数，大多数默认的格函数都不具备对置信区间的强大支持。 Hmisc包扩展了大多数晶格函数，以更好地结合置信区间。

以下是您如何使用它的示例。请注意，我们将您想要绘制的数据组合到data.frame中，以便我们可以使用正确的公式symtax​​

mm<-data.frame(a,stdError, fish=names(a))

library(lattice)
library(Hmisc)
Dotplot(fish~Cbind(a, a-stdError, a+stdError), mm, 
    xlab="mean catch", ylab = "species",las =2)

这会产生

请注意，Hmisc版本的函数名为Dotplot，lattice版本称为dotplot;资本化很重要。

在这里，我只是从平均值中添加/减去了一个标准误差。您可以随意计算置信区间。