在R中绘制3D对象而不是表面

时间:2014-08-08 00:10:40

标签: r 3d rgl

我想根据Z - 值

绘制具有颜色渐变的解剖结构的3D图像

我搜索了有关此主题的先前帮助,例如在3D曲面上hereherehere,但它们似乎都处理具有均匀间隔XY值的数据集。此外,没有一个表面看起来像是在它们周围。

在我正在处理的数据集中(下面的示例),只有X - 值均匀分布。

数据说明:

  1. 来自解剖结构的磁共振成像扫描。所以X是图片编号。
  2. XYZ包含每个点的坐标。
  3. Strand可用于定义线网:
    • X从解剖结构的左侧向右侧单调增加。
    • 对于每个X,有12 Strand个从一个图像(X)到下一个图像。
    • Strand数字从1开始顺时针运行,然后到12以形成多边形。
    • 因此Strand 12紧挨着Strand 1。
    • 最底部的图片显示Strand数字在每个X(图片)中的排列方式。
  4. 有没有人有这方面的经验?或者这在R中是不可行的?

        X   Y       Z       Strand
        1   179.3   213.8   1
        1   184.1   213.8   2
        1   188.8   213.8   3
        1   195.9   214.9   4
        1   200.7   214.9   5
        1   200.7   216.1   6
        1   201.9   219.7   7
        1   195.9   220.9   8
        1   190.0   220.9   9
        1   182.9   222.1   10
        1   178.1   223.3   11
        1   178.1   217.3   12
        2   176.6   213.8   1
        2   182.3   213.8   2
        2   190.6   213.8   3
        2   196.8   214.0   4
        2   201.6   214.0   5
        2   203.4   216.1   6
        2   203.7   218.8   7
        2   197.7   220.9   8
        2   190.0   221.8   9
        2   182.0   223.0   10
        2   176.3   224.1   11
        2   175.5   218.2   12
        3   175.2   213.8   1
        3   181.1   213.8   2
        3   190.6   213.2   3
        3   197.7   213.2   4
        3   203.1   213.2   5
        3   204.3   215.5   6
        3   204.3   217.9   7
        3   198.3   220.3   8
        3   190.6   222.7   9
        3   181.7   223.3   10
        3   175.2   224.4   11
        3   174.0   219.1   12
        4   173.7   214.0   1
        4   180.2   213.8   2
        4   189.4   212.6   3
        4   197.4   212.6   4
        4   204.3   212.6   5
        4   204.5   214.9   6
        4   204.5   217.3   7
        4   198.6   219.7   8
        4   191.2   223.5   9
        4   181.1   223.5   10
        4   174.0   224.7   11
        4   173.1   219.7   12
        5   171.0   214.9   1
        5   179.3   213.8   2
        5   187.6   212.6   3
        5   194.8   212.6   4
        5   204.3   212.6   5
        5   205.4   214.9   6
        5   205.4   217.3   7
        5   199.5   219.7   8
        5   191.2   224.4   9
        5   179.3   224.4   10
        5   172.2   225.6   11
        5   172.2   219.7   12
        6   171.0   214.0   1
        6   178.4   213.8   2
        6   187.6   211.7   3
        6   197.4   211.7   4
        6   205.1   212.6   5
        6   205.4   214.9   6
        6   206.3   217.3   7
        6   199.5   219.7   8
        6   191.2   224.4   9
        6   180.2   224.4   10
        6   172.2   226.5   11
        6   171.3   219.7   12
        7   169.8   214.3   1
        7   176.3   213.8   2
        7   187.0   211.4   3
        7   196.5   211.4   4
        7   205.4   212.6   5
        7   206.0   214.9   6
        7   206.0   217.3   7
        7   199.5   219.1   8
        7   190.6   224.4   9
        7   179.3   224.4   10
        7   171.0   226.2   11
        7   169.8   219.7   12
        8   168.6   214.6   1
        8   174.9   213.8   2
        8   186.1   211.1   3
        8   194.8   211.4   4
        8   205.4   212.9   5
        8   206.3   214.9   6
        8   205.4   217.3   7
        8   198.9   218.8   8
        8   190.0   224.4   9
        8   177.8   224.7   10
        8   169.5   225.9   11
        8   168.6   219.7   12
        9   168.6   213.8   1
        9   175.8   213.8   2
        9   185.3   210.2   3
        9   194.8   211.4   4
        9   205.4   213.8   5
        9   205.4   214.9   6
        9   205.4   217.3   7
        9   197.1   219.7   8
        9   190.0   224.4   9
        9   176.9   225.6   10
        9   168.6   226.8   11
        9   168.6   219.7   12
        10  168.6   212.9   1
        10  175.8   212.9   2
        10  187.0   210.2   3
        10  195.6   211.4   4
        10  203.7   212.9   5
        10  205.4   214.9   6
        10  205.4   217.3   7
        10  196.2   219.7   8
        10  189.1   224.4   9
        10  176.0   224.7   10
        10  169.5   226.8   11
        10  168.6   219.7   12
        11  168.6   212.6   1
        11  175.8   212.6   2
        11  187.6   210.2   3
        11  195.9   211.4   4
        11  203.7   212.6   5
        11  205.4   214.9   6
        11  205.4   217.3   7
        11  195.9   219.7   8
        11  188.2   225.0   9
        11  176.3   225.0   10
        11  169.8   226.8   11
        11  168.6   219.1   12
        12  169.2   212.6   1
        12  176.3   212.9   2
        12  187.9   210.2   3
        12  196.2   211.7   4
        12  204.3   212.6   5
        12  205.1   214.9   6
        12  205.4   217.3   7
        12  196.5   219.7   8
        12  187.9   225.3   9
        12  176.9   225.3   10
        12  169.8   226.8   11
        12  168.9   218.5   12
        13  171.0   212.6   1
        13  178.1   213.8   2
        13  188.8   210.2   3
        13  197.1   212.6   4
        13  204.3   212.6   5
        13  204.3   214.9   6
        13  205.4   217.3   7
        13  198.3   219.7   8
        13  188.8   224.4   9
        13  176.9   224.4   10
        13  169.8   226.8   11
        13  169.8   218.5   12
        14  171.0   212.6   1
        14  176.3   213.8   2
        14  187.9   211.1   3
        14  198.9   212.6   4
        14  204.3   213.5   5
        14  205.1   215.8   6
        14  205.4   218.2   7
        14  198.3   219.7   8
        14  189.7   224.4   9
        14  177.8   225.3   10
        14  170.7   226.8   11
        14  170.7   219.4   12
        15  171.6   212.6   1
        15  176.3   213.8   2
        15  188.2   211.4   3
        15  198.3   212.0   4
        15  204.3   213.2   5
        15  205.4   215.5   6
        15  205.4   217.9   7
        15  198.9   219.1   8
        15  190.0   225.0   9
        15  177.5   225.6   10
        15  171.0   226.2   11
        15  171.0   219.1   12
        16  172.2   212.9   1
        16  177.2   214.0   2
        16  189.1   211.4   3
        16  197.1   211.7   4
        16  203.7   212.6   5
        16  205.1   214.9   6
        16  205.1   217.6   7
        16  199.2   218.8   8
        16  190.0   225.3   9
        16  177.2   225.3   10
        16  171.3   225.9   11
        16  171.3   218.5   12
        17  172.2   213.8   1
        17  178.1   214.9   2
        17  190.0   211.4   3
        17  197.1   212.6   4
        17  201.9   212.6   5
        17  204.3   214.9   6
        17  204.3   218.5   7
        17  198.3   219.7   8
        17  190.0   224.4   9
        17  178.1   224.4   10
        17  172.2   226.8   11
        17  172.2   218.5   12
        18  174.0   213.8   1
        18  179.0   214.9   2
        18  189.1   213.2   3
        18  196.2   213.5   4
        18  201.9   213.5   5
        18  203.4   215.8   6
        18  203.4   218.5   7
        18  197.4   220.6   8
        18  190.0   224.4   9
        18  179.9   224.4   10
        18  173.1   225.9   11
        18  173.1   218.5   12
        19  175.8   213.8   1
        19  181.1   214.9   2
        19  190.0   213.8   3
        19  196.5   213.8   4
        19  201.3   213.8   5
        19  201.9   216.7   6
        19  201.9   219.7   7
        19  196.5   222.1   8
        19  189.4   224.4   9
        19  182.3   224.4   10
        19  175.8   225.0   11
        19  175.2   218.5   12
        20  178.1   214.0   1
        20  183.5   214.9   2
        20  190.9   214.0   3
        20  195.9   214.0   4
        20  199.5   214.0   5
        20  200.1   217.3   6
        20  200.4   220.6   7
        20  195.6   223.3   8
        20  189.1   224.1   9
        20  184.4   224.1   10
        20  178.7   224.4   11
        20  177.8   218.2   12
        21  181.7   214.9   1
        21  185.3   214.9   2
        21  190.0   214.9   3
        21  192.4   214.9   4
        21  195.9   214.9   5
        21  198.3   217.3   6
        21  199.5   219.7   7
        21  194.8   223.3   8
        21  190.0   223.3   9
        21  185.3   223.3   10
        21  180.5   224.4   11
        21  180.5   217.3   12
    

    对于任何给定的图像(X),12个单独的YZ定义结构的外表面并按结构排序:

    Example image showing <code>Strand</code> number

    对于X = 2和Strand = 1,表面三角形可以定义为位于以下位置的点:

    1. 三角

      • X = 2,Strand = 1
      • X = 2,Strand = 2
      • X = 3,Strand = 1
    2. 三角

      • X = 2,Strand = 1
      • X = 1,Strand = 2
      • X = 1,Strand = 1
    3. 三角

      • X = 2,Strand = 1
      • X = 2,Strand = 12
      • X = 3,Strand = 1
    4. 三角

      • X = 2,Strand = 1
      • X = 2,Strand = 12
      • X = 1,Strand = 1
    5. X的1(第一张图片)和12张(最后一张图片)将是一个不同的设置,只是因为它们形成了对象的左右“墙”。

0 个答案:

没有答案